从三维到五维定量构效关系QSAR的研究进展.pdfVIP

中 　国 　药 　科 　大 　学 　学 　报 586 Journal of China Pharmaceutical University 　2003 ,34 (6) :586～591 ·综 　述· 从三维到五维 :定量构效关系( QSAR) 的研究进展 李敏勇 , 夏 　霖① ( 中国药科大学药物化学教研室 , 南京 210009) 【摘 　要】本文综述了近年来定量构效关系的最新发展 ,重点介绍了从三维定量构效关系至五维定量构效关 系的各种方法及应用 ,并就计算机辅助分子设计中 ,定量构效关系所涉及的分子重叠和构象选择问题进行了初 步讨论。 【关键词】　定量构效关系 ; 比较分子场分析法;偏最小二乘法 ;进展 ( ) 【中图分类号】　R914 　　【文献标识码】　A 　　【文章编号】　100025048 2003 0620586206 QSAR 的优势在于可以克服传统 2D2QSAR 的局限性 ,并且 1 　前 　言 可以直观地显现计算结果。分子形状分析后 ,又陆续出现 [2 ] ( 由于计算机软件、硬件的迅速发展 ,特别是 80 年代以 了许多3D2QSAR 方法 ,如 Apex23D ,距离几何学方法 Dis2 ) [3 ] ( ( ) tance Geometry , DG , 比较分子场分析法 Comparative 来计算机图型工作站 如 HP 、SGI 、SUN 的出现 ,为人们处理 药物与受体的结构及药物与受体的相互作用提供了很好的 Molecular Field Analysis ,CoMFA) [4 ] 等。其中 ,在 3D2QSAR 中 平台。人们可以利用这些新方法应用于计算机辅助药物设 最重要的进展是 1988 年 Cramer et al 提出的比较分子场分 ( ) [4 ] 计 ,并出现了新的计算机辅助药物设计方法 ,如 3D2QSAR , 析法 CoMFA 。CoMFA 的成功在于其将分子生物活性与 及 3D 数据库搜索方法、分子对接方法等。这些方法为新 其静电场和立体场联系起来 ,有关 CoMFA 的综述较多 ,本 药设计 ,特别是先导化合物的发现起了重要作用 ,并有了许 文不再重复。 多成功的例子。这说明了计算机辅助药物设计已经进入实 尽管 CoMFA 取得了巨大的成功 ,它仍然存在缺陷。众 用化时代 ,其重要性已经被药物化学家所逐步认识。