tassel5.0关联分析软件中文使用用户手册.pdf

TASSEL5.0 用户手册 Cornell 大学Buckler 实验室 (June 12, 2014) 翻译：陈建国 湖北大学生命科学学院 /tassel 1 声明：虽然Cornell 大学Buckler 实验室已经进行了广泛的测试并且一般来说结果是可靠的、 正确的或合适的，但是对于任何一套特定的数据不能保证一定能够得到你想要的结果。强烈 地建议用户利用其它软件来验证TASSEL 的结果。 更多的帮助：除了这个文档以外还可以得到额外的帮助。欢迎用户报告软件的缺陷，通过 TASSEL 网址申请新的性能。也欢迎对我们现在的团队成员提出问题。要想得到更快速和更 准确的答案，请把你的问题提交给最相关的人： Tassel 用户群（推荐） /group/tassel tassel@ 一般的信息 Ed Buckler （项目领导人） esb33@ 数据输入，Pipeline Terry Casstevens tmc46@ 统计分析 Peter Bradbury pjb39@ Contributors: Ed Buckler, Terry Casstevens, Peter Bradbury, Zhiwu Zhang, Dallas Kroon, Jeff Glaubitz, Kelly Swarts, Jason Wallace, Fei Lu, Alberto Romero, Cinta Romay, Eli Rodgers-Melnick, Alexander Lipka, Sara Miller, James Harriman, Yogesh Ramdoss, Michael Oak, Karin Holmberg, Natalie Stevens, and Yang Zhang. Citations: Overall Package: Bradbury PJ, Zhang Z, Kroon DE, Casstevens TM, Ramdoss Y, Buckler ES. (2007) TASSEL: Software for association mapping of complex traits in diverse samples. Bioinformatics 23:2633-2635. Genotyping by Sequencing: Glaubitz JC, Casstevens TM, Lu F, Harriman J, Elshire RJ, Sun Q, Buckler ES. (2014) TASSEL- GBS: A High Capacity Genotyping by Sequencing Analysis Pipeline. PLoS ONE 9(2): e90346 Mixed Model GWAS: Zhang Z, Ersoz E, Lai C-Q, Todhunter RJ, Tiwari HK, Gore MA, Bradbury PJ, Yu J, Arnett DK, Ordovas JM, Buckler ES. (2010) Mixed linear model approach adapted for genome-wide association studies. Nature Genetics 42:355-360.