中国农业科学院北京畜牧兽医研究所.ppt

梁琳 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 （农业部兽用药物与兽医生物技术北京科学观测实验站 ） 2015.08.09 摘要 信息化越来越多的走入生活，在中国畜牧兽医业发展中也越来越多的被应用。将信息化与分子生物学技术、大数据技术等结合起来。利用信息化技术，可以从网上得到世界各地的全基因组序列，结合现代分子生物学技术、信息学分析技术、分子钟技术，我们可以更为精确的了解病毒从起源到进化，以及更为精确的了解病毒在世界流行和变异情况，以及基因变异在病毒跨宿主传播中的意义。 另外，随着信息化大数据时代的到来，利用信息技术的知识图谱的可视化分析将在动物疫病研究领域发挥更为重要的作用，利用知识图谱可视化软件能够发现一个研究领域的知识基础，着重在一个领域发展中发现关键点，特别是知识转折点和关键点，探测一个领域的研究热点和前沿，有助于科研工作者快速地了解某一个研究领域。 何为“互联网+” 畜牧业 那么，“互联网+畜牧业”，会发生什么？实际上，“互联网+”时代，不仅打破了地域空间的限制，你可以在地球的任何角落，学习有关畜牧兽医的课程；买卖交易、给动物看病咨询。养殖业、销售业、饲料业、科研业务都将发生巨大变化。本文，仅以科学研究单一方面来说一下信息化在中国畜牧兽医业发展中的应用。 第一、信息技术将在动物疫病分子流行病学方面发挥更为重要的作用 以犬细小病毒为例，其感染能引起新生犬急性心肌炎或幼犬出血性肠炎，造成较高的发病率和死亡率。随着CPV-2 对宿主的适应和变异，新抗原变异型( CPV-2a、CPV-2b 和CPV-2c) 不断产生并在世界各地逐步替代了CPV-2 的流行。伴随CPV-2 抗原变异的同时，其对宿主( 犬、猫) 嗜性、毒力等生物学特性也随之改变。 以上图为例，利用信息化技术，可以从网上得到世界各地的全基因组序列，结合现代分子生物学技术、信息学分析技术、分子钟技术，我们可以更为精确的了解其起源到进化，以及更为精确的了解CPV-2 在过去30多年在世界流行和变异情况，以及基因变异在病毒跨宿主传播中的意义。CPV-2 作为细小病毒中最易变异的病毒，伴随其基因/抗原快速变异的同时，新产生的CPV-2 变异株( CPV-2a、CPV-2b 和CPV-2c) 对动物的感染宿主谱也在扩大，严重威胁着家养和野生犬科及猫科动物的生存。有了这样的基因数据库，我们可以利用云技术，随时的查询CPV-2的变化情况。 其他动物病毒也是这样，只有了解病毒的流行趋势，才能遏制或者顺应病毒，做到和谐共生。 第二、利用信息技术的知识图谱的可视化分析将在动物疫病研究领域发挥更为重要的作用 近年来，随着信息化大数据时代的到来，进一步掀起了可视化的浪潮CiteSpace是一款可视化文献分析软件，它能够发现一个研究领域的知识基础，着重在一个领域发展中发现关键点，特别是知识转折点和关键点，能够显示一个学科或知识域在一定时期发展的趋势与动向，形成若干研究前沿领域的演进历程。帮助我们探测一个领域的研究热点和前沿。简单说来，就是找出学术文献中文字（包括：作者，杂志，关键词，被引用词汇等等）的关系。并可视化表示出来。 以猫杯状病毒为例，猫杯状病毒（feline calicivirus，FCV）属于杯状病毒科水疮性病毒属的成员之一，能够引起猫多发性口腔和呼吸道疾病，为单股正链RNA病毒，是杯状病毒科中少有的可以在体外培养的病毒。该病发病率较高，几乎所有的猫科动物均易感，该病毒高度变异，其变异株还可以引起猫全身性致命性疾病，死亡率增加。 为了探究猫杯状病毒研究领域的发展态势，以SCI-E引文数据库中主题为猫杯状病毒的文献数据资料为样本，利用citespaceⅡ软件，绘制国外猫杯状病毒研究领域的知识图谱，进而揭示出该领域研究的核心国家机构，核心作者，研究基础、研究热点、研究前沿及对未来发展的预测。 通过早期的高被引文献可以看出FCV领域的研究，除了FCV感染、传播、基因结构、蛋白结构功能的研究外，对NoV的研究也比较突出，因为NoV是感染人类肠道的一个重要的非细菌性病原，对人有一定的危害，由于它不能够在体外培养，很多都是将FCV、MNV作为其替代病毒进行研究。 结论 以上我们只是举了2个简单的例子来说明信息化在中国畜牧兽医业发展中的应用。实际上，信息化越来越多的走入生活，也越来越多的和分子生物学技术、大数据技术等结合起来，相信会有越来越多的交叉学科，或者称为学科的大融合，这些都有利于科技的发展，更有利于动物疫病的防控，有利于畜牧业的发展，有利于人民生活的提高。 * * * 信息化在中国畜牧兽医 科研上的应用实例 Institute of Animal Sciences of CAAS 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 “互联网+”代表一种新的经济形态，即充分发挥互联网在生产要素配置中的