棉花精氨酸脱羧酶基因1克隆与表达分析.pdfVIP

花 学 报 Cotton Science 20 13 25 渊4 冤院291~299 花精氨酸脱羧酶基因 1 克隆与表达分析 1 1 1 1,2* 1* 亚栋 默辉娟 王省芬 孙艳香 马峙英 1. 河北农业大学/ 河北省作物种质资源重点实验室袁 北保定071001 曰 2. 廊坊师范学院遗传与育种研究所袁 北廊坊065000冤 摘要院以抑制性消减杂交 SSH冤文库序列为基础袁采用生物信息学和RT-PCR 方法从陆地棉中克隆出精氨酸 脱羧酶基因袁命名为 1袁GenBank 登录号为KC851856遥 该基因全长2954 bp 袁其中5 非翻译区477 bp 袁 具有多个参与胁迫响应的顺式作用元 和一个编码8 个氨基酸的微型编码序列 uORF 冤曰 主编码区 mORF 冤 2181 bp 袁共编码726 个氨基酸袁其中N 端具有叶绿体定位信号肽遥 推测的GhADC1 蛋白具有PLP 结合位点及 Orn/Dap/Arg 脱羧酶的信号位点袁属于典型的III 型PLP 依赖型精氨酸脱羧酶家族成员遥 荧光定量RT-PCR 结 果表明袁正常条件下袁 1 在叶片中表达量高于茎和根部组织袁且在抗黄萎病品种冀棉20 中的表达水平 高于耐病品种中521 曰黄萎病菌胁迫能够快速诱导抗病品种根部 1 表达袁而在耐病品种中未见明显差 异袁推测在抗病品种中 1 可能参与根部对黄萎病菌胁迫的早期应答遥 关键词院棉花曰精氨酸脱羧酶基因曰多胺曰黄萎病菌曰基因表达 中图分类号院S562.035.3 文献标志码院A 文章编号院1002-7807 渊20 13冤04-029 1-09 1 1 1 1,2* 1* LI Ya-dong , MO Hui-juan , WANG Xing-fen , SUN Yan-xiang , MA Zhi-ying 渊1. 071001, ; 2. 065000, 冤 Based on a sequence in a suppression subtractive hybridization library, 1, GenBank accession no. KC851856, an arginine decarboxylase gene was cloned from upland cotton using bioinformatics and RT-PCR technologies. The full-length cDNA of 1 was 2954-bp long. The 5 UTR was 477-bp and contained several -acting elements involved in stress re- sponses and a uORF encoding an 8-amino acid sequence. The main ORF was 2 181-bp long, and encoded 726 amino acids with a putative N-terminal chloroplast-targe