蛋白质4三级结构与四级结构.pptxVIP

第五节 蛋白质三级结构 与四级结构一 三级结构二 四级结构三 研究蛋白质构象的方法基本要求一 球状蛋白质的三级结构的特征。二 膜蛋白的结构特点。三 蛋白质的变性和复性四 蛋白质四级结构的特点。一 蛋白质的三级结构 蛋白质的三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是整条肽链的三维结构。（一）、球状蛋白质与三级结构I 球状蛋白质分类：1 全? -结构蛋白2 ?, ? -结构(平行或混合型?-折叠片)蛋白3全 ? -结构蛋白4 富含金属或二硫键蛋白(不规则小蛋白结构)单结构域蛋白、多结构域蛋白1 全α－结构1） 反平行? 螺旋结构域 上下型螺旋束(up-and-down helix bundle) 如：四螺旋束，上下摆放， 轻微左手扭曲2） 珠蛋白型? -螺旋蛋白： 相邻的两螺旋接近相互垂直蚯蚓肌红蛋白烟草花叶病毒蛋白流感病毒血凝素子宫珠蛋白1 全α－结构2.α,β-结构1）单绕平行β桶 含平行?折叠片 或?, ?混合结构。 ?折叠片两侧都分布有疏水侧链，常位于蛋白质的核心。丙糖磷酸异构酶（侧）丙酮酸激酶丙糖磷酸异构酶（顶）2.α,β-结构1）单绕平行β桶 肽链按Rossmann折叠方式单向卷绕而成的闭合式圆桶结构2.α,β-结构1）单绕平行β桶2）双绕平行β片 由?片扭曲成马鞍形，?-螺旋分处扭曲片的两侧。3 全 ? (反平行?) -结构域：反平行?-折叠片为主两个亚类：1）反平行?-桶 ?-折叠片扭曲后围绕而成类似桶型的结构2）反平行?片 1）反平行?-桶： 希腊钥匙型: 超二级结构希腊钥匙闭合而成 果冻卷型(jell roll ?-barrel)：伴刀豆凝集素A 上下型： ?-meander对合而成玉红氧还蛋白木瓜蛋白酶结构域2大豆胰蛋白酶抑制剂3.全β-结构1）反平行?-桶——上下型伴刀豆凝集素晶体蛋白2）反平行?片 也称露面夹心(open-face sandwish)结构 ?-折叠片上有一层?-螺旋，由回环连接，不闭合成桶。链霉属枯草杆菌蛋白酶甘油醛-3-磷酸脱氢酶结构域2谷胱甘肽还原酶结构域34. 富含金属或二硫键的蛋白质 一般小于100aa残基 结构域不规则 很少量二级结构 富含金属或二硫键， 有稳定结构域作用4.富含金属或二硫键的蛋白质胰岛素磷脂酶A2铁氧还蛋白高氧还势铁蛋白II 球状蛋白质三维结构的特征1、含多种二级结构元件2、明显折叠层次3、紧密折叠近球状4、内部：疏水侧链，表面：亲水侧链 使球蛋白具有水溶性5、表面有空穴（疏水）：结合、活性部位How a protein folds into a globular conformation.The polar amino acid side chains tend to gather on the outside of the protein, where they can interact with water. The nonpolar amino acid side chains are buried on the inside to form a hydrophobic core that is hidden from water. III 球状蛋白与三级结构 球状蛋白有些是单亚基的，称单体蛋白质；有些是多亚基的，称寡聚或多聚蛋白质。亚基一般是一条多肽链。亚基（包括单体蛋白质）的总三维结构称三级结构。 三级结构是在二级结构基础，进一步盘绕、折叠形成，包括主链、侧链构象在内特定空间结构。立体结构模型（二）膜蛋白(membrane proteins)的结构I 膜蛋白质分类1膜周边蛋白质(peripheral protein)： 也称为膜外周蛋白。与脂双层的外部亲水部分结合或通过其他蛋白与膜相联系，一般是可溶性的。与球蛋白相似2膜内在蛋白质 (integral protein)或内在膜蛋白： 镶嵌或埋没在膜中，与膜结合牢固3 脂锚定蛋白质(lipid-anchored protein)： 利用脂锚钩(lipid anchor) 结合于膜上Membrane proteinsFigure 1.9 Six ways in which membrane proteins associate with the lipid bilayer. Most trans-membrane proteins are thought to extend across the bilayer as a single a helix (1) or as multiple a helices (2); some of these single-pass and multipass proteins have a covalently attached fa