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第三章 基因工程的工具酶;第一节 基因工程的工具酶;一、限制性核酸内切酶(Endonucleosase);2)限制性核酸内切酶的类型;(二)II类限制性内切酶的命名及特性 ;(三)II类限制性内切酶的底物识别顺序及切割位点 ;几种最常用的限制性核酸内切酶 ;二、T4-DNA连接酶(T4-DNA Ligase) ;三、核酸酶 ;(一) Bal 31(来自于细菌 Alteromonas espejiana)
单链特异内切,双链特异外切,依赖于Ca2+ 用途: 构建限制酶图谱 产生末端缺失突变 DNA超螺旋线性化
(二)E. coli外切酶III 只降解DNA分子的一条链,产生单链的DNA分子。;(三)S1核酸酶(来源于米曲霉菌) 特性: 1. 降解单链DNA或RNA,降解DNA的速度大于降解RNA的速度 2. 降解发生的方式为内切 3. 酶切活性需4.0-4.5pH环境,Zn2+激活 4. 酶量过大时会降解双链核酸,因为双链降解活性比单链低75000倍 ;(四) DNase I: 来自于牛胰腺,既可以降解单链也可以降解双链,没有特异性,产生单核苷酸或短链
(五)RNase H:
切割DNA—RNA杂交双链中的RNA序列,使杂交双链变成单链DNA结构;四、聚合酶 ;(二) Klenow酶 ;(三) T4 DNA聚合酶 ;(四)T7 DNA聚合酶 测序酶
(五) Taq DNA聚合酶 耐高温,主要用于PCR反应; DNA聚合酶活性 RNase H活性 DNA内切酶活性 核酸结合活性;反转录酶的基本特性:以RNA为模板聚合cDNA链;反转录酶的基本特性: (RNase H)
双向外切DNA-RNA杂合链中的RNA链;五、DNA修饰酶 ; 3) 末端脱氧核苷酸转移酶(terminal deoxynucleotidyl tansferase)
来自于小牛胸腺组织,在DNA分子的3‘端增加一个或多个脱氧核苷酸。;DNA重组技术中最常用的工具酶 ;第二节 DNA的切割反应;一、缓冲系统的组成 ;二、酶切操作 ;三、酶切结果分析 ;2) DNA分子的检测
a. 染色EB,DNA分子小于25ng,很难检测到。 b. 放射性自显影, 可以监测少到2ng DNA分子。 ;(二)估计DNA分子的大小
根据DNA分子的迁移率,可以用公式计算出分子量
D= a – b (logM)
D是移动的距离,M是分子量,a, b是恒量但随着电泳条件的改变而改变。 也可根据已知大小的片段进行比较,误差约在5%左右。;四、多酶联合酶解 ;五、定位酶切位点 ;六、 限制性内切酶的star活性
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