分子辅助育种的常见分子标记.pptxVIP

种子生产与经营专业教学资源库《遗传学》分子辅助育种的常见分子标记内容一分子标记育种的定义二分子标记辅助育种需具备的基本条件三常见分子标记一、分子标记辅助育种定义分子标记辅助育种：利用分子标记与决定目标性状基因紧密连锁的特点，通过检测分子标记，即可检测到目的基因的存在，达到选择目标性状的目的，具有快速、准确、不受环境条件干扰的优点。相关的品种、亚种、种基因转移相关的品种、亚种、种传统育种法:表型选择基因转移相关的品种、亚种、种相关的品种、亚种、种标记辅助选择:基因型选择由此可见，传统育种法和标记辅助选择法在本质上没有什么区别，但在选择效率和准确性方面，后者比前者大大提高。RM491.8RM1860.6RM558.53.3RM1681.7MRG49241.7RM4160.3AC8878a0.1AC2823a0.0bel0.4AC2827a1.2RM38671.6MRG1004三、 分子标记辅助育种需具备的基本条件1、分子标记与目标基因共分离或紧密连锁；2、分子标记检测容易，重演性好；3、基本实验手段及计算机统计分析软件。三、常见的分子标记（一）、RFLP标记1、定义：RFLP，即限制性片段长度多态性，是指用限制性内切酶酶切不同个体的基因组DNA后，含有与探针序列同源的酶切等位片段在长度上的差异。2、应用：（1）植物遗传连锁图的构建；（2）分子标记辅助选择；（3）遗传关系分析及数量遗传研究等。三、常见的分子标记3、该技术包括以下基本步骤：（1）DNA提取；（2）用DNA限制性内切酶消化；（3）凝胶电泳分离限制性片段；（4）将这些片段按原来的顺序和位置转移到易操作的滤膜上；（5）用放射性同位素或非放射性物质标记的DNA作探针与膜上的（6）DNA杂交（称 Southern杂交）；（7）放射性自显影或酶学检测显示出不同材料对该探针的限制性酶切片段多态性。 三、常见的分子标记（二）、AFLP标记1、定义：即扩增片段长度多态性，是一种将RFLP与PCR相结合的分子标记。2、基本原理：其基本原理是对基因组DNA限制性酶切片段进行选择性扩增，模板是连接双链人工接头的酶切片段，引物的结合部位是接头以及与之相连的酶切片段中的几个碱基序列。AFLP基本原理3、AFLP标记的特点：（1）由于AFLP分析可以采用的限制性内切酶及选择性碱基种类、数目很多，所以该技术所产生的标记数目是无限多的；（2）典型的AFLP分析，每次反应产物的谱带在50-100条之间，所以一次分析可以同时检测到多个座位，且多态性极高；（3）表现共显性，呈典型孟德尔式遗传；（4）分辩率高，结果可靠；（5）模板DNA用量少，而且对模板浓度的变化不敏感； （6）目前该技术受专利保护，用于分析的试剂盒昂贵，实验条件要求较高。三、常见的分子标记（三）、SSR标记1、基本原理：SSR即微卫星DNA，是一类由几个（多为1-5个）碱基组成的基序串联重复而成的DNA序列，其长度一般较短，广泛分布于基因组的不同位置，如（CA）n、（AT）n、（GGC）n等重复。不同遗传材料重复次数的可变性，导致了SSR长度的高度变异性，这一变异性正是SSR标记产生的基础。三、常见的分子标记尽管微卫星DNA分布于整个基因组的不同位置，但其两端序列多是保守的单拷贝序列，因此可以根据这两端的序列设计一对特异引物，通过PCR技术将其间的核心微卫星DNA序列扩增出来，利用电泳分析技术就可获得其长度多态性，即SSR标记。ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT微卫星多态性分析示意图123PCR 扩增123三、常见的分子标记2、SSR标记的特点：（1）数量丰富，广泛分布于整个基因组；（2）具有较多的等位性变异；（3）共显性标记，可鉴别出杂合子和纯合子；（4）实验重复性好，结果可靠；（5）由于创建新的标记时需知道重复序列两端的序列信息，因此 其开发有一定困难，费用也较高。 谢谢观看Thank you for watching