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教学内容第一节 基因的概念 第二节 病毒基因组 第三节 原核生物基因组第四节 真核生物基因组第五节 基因组学第一节 基因的概念 一、基因概念的发展二、基因的分子生物学定义三、基因组奥地利布隆(Brünn):现捷克布尔诺(Bruo)孟德尔豌豆杂交实验中所用的七对相对性状 一、基因概念的发展(一)孟德尔的遗传因子 生物体的各种特定性状受遗传因子所控制,一个因子决定一种性状。 Thomas H.Morgan摩尔根实验一、基因概念的发展 (二)摩尔根的基因概念 基因以直线形式排列,它决定着一个特定的性状,而且能发生突变并随着染色体同源节段的互换而交换,它不仅是决定性状的功能单位,而且也是一个突变单位和交换单位,即著名的三位一体概念。 cis-trans testcis-trans test 一、基因概念的发展 (三)顺反子 一个顺反子(cistron)相当于一个基因,它是一个功能单位,决定一个酶或一条多肽链的表达。顺反子(基因)内部可以出现不同位置的突变,也可以出现交换和重组。一个顺反子可以包括很多突变子和重组子。一、基因概念的发展 (四)操纵子及其基因 操纵子(operon)是原核生物基因表达调控单元。 操纵子基因根据功能可分为结构基因(structure gene)、调节基因(regulatory gene)和控制基因(包括启动基因和操纵基因)三类。结构基因和调节基因是可表达的基因,控制基因是不可表达的基因。 操纵子一、基因概念的发展(五)现代基因概念的扩展重叠基因(overlapping genes) 断裂基因(split gene) 跳跃基因(jumping gene) 假基因(pseudogene) 断裂基因(split gene)二、基因的分子生物学定义 一个基因不仅是编码有功能的蛋白质多肽链或RNA所必需的核酸序列(通常指DNA序列),而且还包括为保证转录所必须的调控序列、5端非翻译序列、内含子以及 3非翻译序列等核酸序列。 根据基因是否具有表达功能可以将其分为三类:第一类是编码蛋白质的基因,它具有转录和翻译功能;第二类是只有转录功能而没有翻译功能的基因,包括tRNA基因和rRNA基因;第三类是不转录的基因,它对基因表达起调节控制作用,包括启动基因和操纵基因,这类基因也称控制基因。 三、基因组概念 在个体水平代表一个个体所有遗传性状的总和,在细胞水平代表一个细胞所有不同染色体(单倍体)的总和,在分子水平代表一个物种所有DNA分子的总和。简而言之,它表示一种生物的DNA或RNA所含的全部遗传信息。 人类基因组 人类基因组由22条常染色体和2条性染色体,约30亿个碱基对的DNA序列组成,估计约含3~4万个基因。 第二节 病毒基因组一、病毒基因组核酸的类型7种类型:1.双链DNA(dsDNA)病毒;2.单链DNA(ssDNA)病毒;3.双链RNA(dsRNA)病毒;4.单链正链RNA(the positive-sense ssRNA) 病毒;5.单链负链RNA(the negative-sense ssRNA)病毒;6.逆转录RNA病毒;7.逆转录DNA病毒。二、病毒基因组的结构特点1.病毒基因组可以由DNA或RNA组成 2.病毒基因组大小相差较大 3.病毒基因组为单拷贝 4.病毒基因组多由连续的多核苷酸链组成 5.病毒基因组的基因可连续或间断 6.病毒基因组的大部分是用来编码蛋白质 7.病毒基因组的相关基因往往丛集形成一个功能 单位或转录单元 8.有重叠基因 第三节 原核生物基因组一、原核生物基因组的结构特点1.基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成; 2.基因组中只有1个复制起始点;3.具有操纵子结构,转录产物为多顺反子; 4.一般无重叠基因;5.无内含子; 6.编码蛋白质的DNA在基因组中所占比例较大; 7.结构基因为单拷贝; 8. 具有编码同工酶的基因; 9.存在插入序列(insertion sequence,IS)和转座子(transposon)等可移动的DNA序列;10.具有多种的功能识别区域。 二、质粒概念 质粒(plasmid)是细胞染色体或核区DNA外能够自主复制的共价闭合环状DNA (covalent closed circular DNA, cccDNA) 分子。 质粒对宿主细胞的生存而言不是必需的, 宿主细胞丢失了质粒依然能够存活。但质粒所携带的遗传信息能赋予宿主细胞特定的遗传性状。质粒DNApBR322EcoRⅠ、PstⅠ、HindⅢ、BamHⅠ、SalⅠ只有一个酶切位点,便于外源基因的插入。第四节 真核生物基因组一、真核生物基因组的组成基因和基因相关DNA序列 包括编码的DNA序列和非编码的DNA序列(如内含子、基因片段和假基因等)基因外DNA序列 包括
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