从质谱数据鉴定多肽的蛋白质.pptVIP

数据库搜索：小结 数据库搜索算法的目标是在数据库中寻找与二级质谱图最好匹配的多肽。 我们讲解了二级质谱的形成过程，但是实际的二级质谱并不是那么完美的。 作为一个搜索算法的例子，从Sequest中可以知道搜索算法通常的步骤。 后筛选是鉴定多肽过程中非常重要的一步，但目前的研究并不完善。 本讲座小结 本讲座中，我们介绍了用于鉴定一级质谱的多肽质量纹（PMF）和用于鉴定二级质谱的数据库搜索算法。 鉴定一级质谱时，可用的信息较少，所以算法比较简单而完善，但其作用有限。 鉴定二级质谱比较复杂，涉及的步骤也较多，目前的方法仍未臻完善。 鉴定质谱图是很重要的工作。可以说，没有一个好的鉴定算法，蛋白质组学就难以像基因组那样快速的发展。 蛋白质鉴定的图示 质谱图 De-novo Sequencing 序列数据库 一级质谱 二级质谱 质量纹 数据库检索 后筛选 蛋白质 未知多肽 PSMs 思考题 你认为质谱图鉴定中的后筛选步骤是否有必要作为一个独立的步骤？为什么？ 谢谢大家！ 通过残基鉴定多肽 De-novo Sequencing 这种通过残基来鉴定多肽的方法被称为De-novo Sequencing。 当我们拥有近乎完美的二级质谱图时，我们可以采用这种De-novo Sequencing的办法。 但是，实际情况中，我们并没有完美的二级质谱图，而一点点的不完美，带来的误差是惊人的。 氨基酸质量表