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;1 CRISPR-Cas概述;1 CRISPR-Cas概述;CRISPR-Cas主要由两部分组成:;1.1 CRISPR结构;1.1 CRISPR结构;1.2 Cas家族;2 CRISPR-Cas系统的发现;2 CRISPR-Cas系统的发现;2 CRISPR-Cas系统的发现;2 CRISPR-Cas系统的发现;2 CRISPR-Cas系统靶向要求;2 CRISPR-Cas系统靶向要求;2 CRISPR-Cas系统靶向要求;3 CRISPR-Cas系统介导基因修饰;3.1 dual-RNA:Cas介导编辑模板替换;3.1 dual-RNA:Cas介导编辑模板替换;3.2 sg-RNA:Cas介导基因修饰;3.2 sg-RNA:Cas介导基因修饰;3.2 sg-RNA:Cas介导基因修饰;3.2 sg-RNA:Cas介导基因修饰; 2013年2月15日在《science》上发表的《Multiplex Genome Engineering Using CRISPR/Cas Systems》一文中,作者利用一个包含两个靶向不同基因的spacers的crRNA实现了同时对两个基因进行编辑。;3.3 cr-RNA:Cas介导双基因修饰 ;4 CRISPR-Cas系统前景分析;4 CRISPR-Cas系统前景分析;4 CRISPR-Cas系统前景分析;4 CRISPR-Cas系统前景分析;1987年,当时有一个科研小组观察到,在细菌编码的一个基因末端有一段非常奇怪的重复序列。
越来越多的生物学家们开始从事微生物基因组的解析工作,这时他们也都发现了这种奇怪的现象
在大约40%的细菌和90%的古细菌(archaea)中都能够观察到这种现象,于是科学家们给这种序列取了一个名字,叫作CRISPR,即成簇的、规律间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)。
在2005年,有3个生物信息学课题组报道称,这些 CRISPR序列里的空格DNA总是能够与噬菌体的 DNA序列互补、匹配
美国马里兰州美国国家癌症生物技术信息中心的Eugene Koonin等人提出了一个新想法,即细菌和古细菌能够吸收噬菌体的DNA,然后将其留作己用,并转录出相应的RNA,与入侵的外源DNA结合,这有点类似于真核生物采用的RNA干扰(RNA interference, RNAi)机制。
Danisco公司的研究人员 Rodolphe Barrangou、Philippe Horvath等人在2007年发现,他们只要对嗜热链球菌进行一番遗传学改造,插入或者去掉几个与噬菌体序列互补的空格DNA片段,就可以改变细菌对噬菌体的免疫力。;Doudna和Emmanuelle Charpentier则分别把工作往前推进了一步,依赖Cas9蛋白的CRISPR系统要比其它 CRISPR系统更简单。
Doudna和Charpentier的课题组都必须证明,他们能够非常精确地控制Cas9蛋白的切割位点,确保不会???生脱靶的情况。
Doudna的博士后Martin Jinek提出了将tracrRNA和空格 RNA组合起来,形成一个所谓的“向导RNA分子(single-guide RNA)”的想法,并且他们课题组已经在去年成功地构建出了好几个这种向导RNA,而且将其与Cas9蛋白混合在一起,成功地对特定的DNA位点进行了切割(Science , 17 August 2012, p. 816)。
;十年前,科学家们开发出了锌指核酸酶(zinc finger nucleases),该蛋白拥有两个人工组合在一起的结构域,它可以依靠其中的 DNA结合结构域(DNA-binding domains)结合到基因组中特定的位点上,然后再依靠其中的酶切结构域将该位点的DNA链切断。该技术诞生之后也掀起了一股热潮,甚至有人成立了公司,专门以该技术为平台开发艾滋病治疗手段(Science , 23 December 2005,p. 1894)。
;最近又出现了另外一种基因组改造工具,那就是TALEN人工核酸酶,这是一种比锌指核酸酶更方便的基因组定向改造工具,并且有可能会彻底取代锌指核酸酶(Science, 14 December 2012, p. 1408)。
;CRISPR系统是以 RNA作为基因组定位工具,而锌指核酸酶和 TALEN核酸酶则都是以人工开发的特异性 DNA位点结合蛋白作为基因组定位工具。
合成RNA要比合成蛋白质容易得多,,用CRISPR技术只需要几个星期就可以拿到确定的实验结果,可人工核酸酶技术至少需要好几个月。”
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