RNA甲基化修饰(3)——m6A调节果蝇性别分化和神经功能.pdfVIP

RNA 甲基化 m6A 调节果蝇性别分化和神经功能 | 案例解析 标题：m6A modulates neuronal functions and sex determination in Drosophila m6A 调节果蝇性别分化和神经功能 发表时间：2016 年 12 月 发表期刊：Nature IF ：40.1 机构：德国美因茨大学 1、前言 RNA 修饰在表观转录调控中十分重要，其中 m6A 修饰在许多哺乳动物中广泛存在。 许多真核生物中都存在 m6A 修饰，包括人、小鼠、斑马鱼甚至酵母。许多研究表明大量的 m6A 修饰落在了 RRACH motif （R, purine; H, non-guanine base ）内，另外终止密码子 和 3’ UTR 区域也有大量的 m6A 修饰。RNA 甲基化修饰参与许多转录后调控 ，包括 mRNA 前体剪切 ，mRNA 降解和翻译，其中的“reader”酶 YTH 家族起到十分重要的作用。RNA 甲基化转移酶（methyltransferase ）能够催化腺苷酸N6 位发生甲基化，包括 METTL3、 METTL14、WTAP、Vir 等。而去甲基化酶包括 FTO 和 ALKBH5。 已知在小鼠胚胎干细胞中将 METTL3 敲除（ knockout ）后能够阻止其发生分化， MELLT3 基因功能缺失对小鼠胚胎干细胞的发育具有致死做用。同样在果蝇中，METTL3 的 同源蛋白 Ime4 被敲除后也具有亚致死作用，由于 NOTCH 信号通路受损从而影响果蝇的生 育能力。在模式植物拟南芥中，METTL3 同源蛋白 Ath-MTA 被敲除后，其发育也会受到很 大影响。另外，Ime4 基因对酵母的减数分裂也有很重要的作用。种种迹象表明 ，m6A 修饰 对生物早期性器官发育以及早期的胚胎发育至关重要。近几年的结构生物学研究表明 ， RNA 甲基化 METTL3 和 METTL14 会形成杂络物行使催化作用，但是生物体内的作用机制至今仍然未 知。参与 RNA 甲基化的酶包括： 类别 基因 功能 METTL3 和 METTL14 形成杂络物，在体内和体外催化 METTL3, METTL14, WTAP, RNA 发生 m6A 甲基化修饰。而 WTAP （Fl(2)d ）和 Writers KIAA1492 KIAA1492 （Vir ）以及其他factors 也杂络物的重要组 成部分。这些 Writers 都有 consensus motif FTO, ALKBH5 以 及 其 他 Erasers 去甲基化酶 ，介导 m6A 去甲基化修饰 homologies 识别 RNA 甲基化修饰的信息，并参与下游 RNA 的翻 YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3 以 Readers 译、降解等过程。这些 YTHDF 家族的蛋白普遍都含有 及其他同源家族蛋白 YTH domain 2.果蝇神经系统存在较高的 m6A 修饰 昆虫整个生命周期包括胚胎期、幼虫期（一龄幼虫→三龄幼虫）、蛹期以及成虫期。作 者先检测了野生型果蝇各个时期的 m6A 整体的甲基化水平，使用质谱法对 Ime4、dMettl14 和 fl(2)d 三种蛋白相对表达水平做了一个热图。从热图中我们可以发现在胚胎早期尤其是 2 小时后 m6A 水平处于一个很高的水平，之后开始下降。在三龄幼虫期，m6A 水平开始上 升 ，在蛹期又达到了一个高峰后逐渐下降。果蝇成虫期的头部以及卵巢中m6A 水平也一直 维持相对较高水平。