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一、真核基因组结构特点;● 基因组很小,大多只有一条染色体
● 结构简炼
● 存在转录单元多顺反子;二、真核细胞与原核细胞在基因转录、翻译及DNA的空间结构方面存在以下几个方面的差异 ;① 在真核细胞中,一条成熟的mRNA链只能翻译出一条多肽链,很少存在原核生物中常见的多基因操纵子形式。
;③ 高等真核细胞DNA中很大部分是不转录的,大部分真核细胞的基因中间还存在不被翻译的内含子。; ⑤ 在真核生物中,基因转录的调节区相对较大,它们可能远离启动子达几百个甚至上千个碱基对,这些调节区一般通过改变整个所控制基因5’上游区DNA构型来影响它与RNA聚合酶的结合能力。
在原核生物中,转录的调节区都很小,大都位于启动子上游不远处,调控蛋白结合到调节位点上可直接促进或抑制RNA聚合酶与它的结合。;⑥ 真核生物的RNA在细胞核中合成,只有经转运穿过核膜,到达细胞质后,才能被翻译成蛋白质,原核生物中不存在这样严格的空间间隔。;三、基本概念;1、简单多基因家族
简单多基因家族中的基因一般以串联方式前后相连。;The eukaryotic ribosomal DNA repeating unit;2、复杂多基因家族;Organization of histone genes in the animal genome;(二)断裂基因;;1、外显子与内含子的连接区;2、外显子与内含子的可变调控;(三)假基因;根据其性质可分为两大类:;第一节 DNA水平的调控;一、基因丢失
在细胞分化过程中,通过丢掉某些基因而去除其活性。例如某些原生动物,线虫、昆虫、甲壳类动物,体细胞常丢掉部分或整条染色体,只保留将来分化产生生殖细胞的那套染色体。
例如在蛔虫胚胎发育过程中,有27%DNA丢失。在高等动植物中,尚未发现类似现象。
许多生物各类不同的细胞或细胞核都具有全能性totipotency;二、基因扩增;基因组拷贝数增加,即多倍性,在植物中是非常普遍的现象。基因组拷贝数增加使可供遗传重组的物质增多,这可能构成了加速基因进化、基因组重组和最终物种形成的一种方式。;DNA含量的发育控制 利用流式细胞仪对从拟南芥不同发育阶段的组织中分离到的间期细胞核进行分析,发现多倍体的DNA含量与组织的成熟程度成正比。对于一给定???物种,C是单倍体基因组中的DNA质量。;将一个基因从远离启动子的地方移到距它很近的位点从而启动转录,这种方式被称为基因重排。
通过基因重排调节基因活性的典型例子是免疫球蛋白结构基因的表达。;; 基因重排;1、酿酒酵母接合型的决定;2、Cassette model 匣子模型;活跃匣子表达,HML和HMR保持沉默?;与活跃匣子不同类型的沉寂匣子可以取代活跃匣子,改变接合型; 接合型的改变,实际上是DNA序列的代换,依赖于序列同源性
与活跃匣子不同类型的沉寂匣子可以取代活跃匣子,改变接合型
匣子 W X Y Z1 Z2 total
HML? 723 704 747 239 88 2501
MAT? 723 704 747 239 88 2501
MATa 723 704 642 239 88 2369
HMRa 704 642 239 1585;;四、DNA的甲基化与基因调控:;在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要出现在CpG序列、CpXpG、CCA/TGG和GATC中 ;真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性:;;2、DNA甲基化抑制基因转录的机理;第二节 染色质水平上的基因活化调节;真核细胞中基因转录的模板是染色质而不是裸露的DNA,因此染色质呈疏松或紧密结构,即是否处于活化状态是决定RNA聚合酶能否有效行使转录功能的关键。;活性染色质的主要特点;活性染色体结构变化;2. DNA拓扑结构变化;4. 组蛋白变化;活性染色质上具有DNaseI超敏感位点。每个活跃表达的基因都有一个或几个超敏感位点,大部分位于基因5′端启动子区域。;活性染色质上具有核基质结合区( matrix attachment region ,MAR)。MAR一般位于DNA放射环或活性转录基因的两端。在外源基因两端接上MAR,可增加基因表达水平倍以10上,说明MAR在基因表达调控中有作用。是一种新的基因调控元件。;;第三节 转录水平的调控;一、基因转录的顺式调控元件 cis-element;;;2、Enhancer sv40;促进转录,不具有启动
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