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肽键(peptide bond):是由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合而形成的化学键。
一、肽键
1. 定义
二、肽单元 (peptide unit)
参与组成肽键的6个原子位于同一平面,又叫酰胺平面或肽键平面。它是蛋白质构象的基本结构单位。
1. 定义
H
H
H
H
多肽链:通过可旋转的Cα连接的酰胺平面链
这种旋转是受到限制的
φ 和ψ= 0°时的主链构象
2. 肽平面的性质
肽平面键长和键角一定
肽键有40%的双键性质,相关的6个原子 处在同一平面 (肽平面、酰胺平面)
肽键的原子排列呈反式构型
相邻的肽平面构成两面角
三 、 肽的命名
1)以氨基酸残基的数量命名
2-12个:二肽、三肽、四肽……
12-20个: 寡肽
20个:多肽
2)以氨基酸残基的名称命名
从N端开始,连续读出氨基酸残基的名称,并将“酸”改为“酰”。
举例:丝氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸
四、肽的书写
NH2末端(N端)放在左边,COOH末端(C端)放在右边,用连字符将氨基酸从N端到C端连接起来
举例: Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu
S-G-Y-A-L
1) 已知氨基酸序列
2)未知氨基酸序列
将氨基酸及数量写在括号内,并以逗号间隔
举例: (Ala, Cys2, Gly)
N 末端:多肽链中有自由氨基的一端
C 末端:多肽链中有自由羧基的一端
多肽链有两端
* 多肽链(polypeptide chain)是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。
多肽链中AA残基按一定顺序排列:氨基酸顺序
含游离-氨基的一端:氨基端或N-端
含游离-羧基的一端:羧基端或C-端
AA顺序是从N-端开始以C-端氨基酸残基为终点
如上述五肽:Ser-Val-Tyr-Asp-Gln
N末端
C末端
牛核糖核酸酶
1、 肽的酸碱性质
短肽在晶体和水溶液中是以偶极离子形式存在。
肽的酸碱性质取决于N端α-NH2和C端α-COOH以及侧链R上可解离的基团。
在长肽或蛋白质中,可解离的基团主要是侧链基团。
五、肽的重要性质
2、 旋光性
一般短肽的旋光度等于其各个氨基酸的旋光度的总和。
肽末端α-羧基pKa值比游离AA中的大。
肽末端α-氨基pKa值比游离AA中的小。
3、 解离系数
六、生物活性肽(BAP)
定义
调节生物体的生命活动或具有某些生理活性的寡肽和多肽的总称
2.作用:
调节酶类,保障代谢,影响蛋白质合成
1)谷胱甘肽(glutathione, GSH)
结构:
3.常见生物活性肽
GSH过氧化物酶
GSH还原酶
NADPH+H+
NADP+
GSH的转化:
GSH是细胞内十分重要的还原剂
-SH为活性基团,参与氧化还原过程,清除内源性过氧化物和自由基,维护蛋白质活性中心的巯基处于还原状态;
为酸性肽;
红细胞中的巯基缓冲剂。
谷胱甘肽的功能
多肽类激素主要见于垂体及下丘脑分泌的激素,如催产素(9肽)、加压素(9肽)、促肾上腺皮质激素(39肽)、促甲状腺素释放激素(3肽)。
神经肽主要与神经信号转导作用相关,包括脑啡肽(5肽)、-内啡肽(31肽)、强啡肽(17肽)等。
2)多肽类激素及神经肽
催产素:
促平滑肌收缩、催产、排乳、促进遗忘
加压素:
升高血压、抗利尿、促进记忆
3)促肾上腺皮质激素(ACTH)
腺垂体分泌,作用于肾上腺皮质
刺激肾上腺皮质的生长和肾上腺皮质激素的合成和分泌
可用于关节炎、皮肤和眼睛炎症的治疗
4)脑啡肽(5肽)
Met--- 脑啡肽:
Tyr—Gly—Gly—Phe—Met
Leu----脑啡肽:
Tyr—Gly—Gly—Phe—Leu(已人工合成)
具有镇痛作用。
生物体内活性肽的来源
体内途径:非活性的蛋白质前体经特殊的酶系加工形成。肽链+信号肽
内质网(激素原前体)
高尔基体
肽链选择性酶切(位点为成对碱性氨基酸,以Lys-Arg为主)
体外途径:
分离纯化天然活性肽
化学合成
生物合成
酶法水解
第四节 蛋白质的结构
蛋白质的分子结构包括
一级结构
二级结构
超二级结构
结构域
三级结构
四级结构
空间结构
一、蛋白质的一级结构
蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。
★其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。
2、主要的化学键
二硫键的位置属于一级结构研究范畴。
肽键,有些蛋白质还包括二硫键
1、定义
一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。
二、蛋白质的空间结构
1、定义
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