多重PCR方法对大肠杆菌的毒力基因分型与系统进化分类.pdfVIP

现代食品科技 Modern Food Science and Technology 2014, Vol.30, No.3 多重PCR对大肠杆菌的毒力基因分型与 系统进化分类的研究 1 1 2 3 1 倪奕弘 ，陈沿廷 ，魏霜 ，James Chin ，吴希阳 （1.暨南大学理工学院食品科学与工程系，广东广州 510632）（2.汕头市出入境检验检疫局，广东汕头 515041） （3.伊丽莎白麦克阿瑟农业学院，新南威尔士康登 2570） 摘要：本文对不同来源大肠杆菌的毒力基因分布情况进行调查及系统进化分类，探讨大肠杆菌的系统进化分类与毒力基因携带 的关联。本研究针对引起人类和动物肠道内或肠道外疾病的6 种病原型大肠杆菌的 47 个毒力基因，采用多重 PCR 方法对 38 株大肠 杆菌和 4 株志贺氏菌进行毒力基因的分布调查及系统进化分类。肠道致病大肠杆菌中携带其病原型标志毒力基因和多种肠外致病大肠 杆菌的毒力基因；非致病性大肠杆菌也携带某些肠外致病大肠杆菌的毒力基因，但是两者都不含肠道致病大肠杆菌的毒力基因。对 42 株菌的系统进化分类结果表明，大多数肠外致病大肠菌株属于 B2 或 D。肠道临床菌株中大部分被归为D （19.2% ）、B1 （50.0% ） 和A （30.8% ），3 株非致病性菌株 DH5α,BL-21 和XL-10 属于 A。大肠杆菌毒力基因的携带和系统进化之间有很显著的联系，肠道内 与肠道外的感染与不同的毒力基因相关联。 关键词：多重PCR；大肠杆菌；系统进化分型；毒力基因 文章篇号：1673-9078(2014)3-38-42 Multiplex PCR Assays for Escherichia coli Phylogenetic Assignments and Virulence Gene Ownership 1 1 2 3 1 NI Yi-hong , CHEN Yan-ting , WEI Shuang , James Chin , WU Xi-yang (1.Department of Food Science and Engineering, Jinan University, Guangzhou 510632, China) (2.Shantou Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau, Shantou 515041, China) (3.Elizabeth Macarthur Agriculture Institute, NSW Department of Primary Industries, Camden, NSW 2570, Australia) Abstract: The relationship between different phylogroups and virulence genes of E.coli from various origins were identified. Forty-seven virulence genes (VGs) markers found in six pathotypes of E. coli known to cause intestinal and extra-intestinal disease in humans or animals were investigated. Multiplex PCR assays were used to screen 42 strains including clinical and commensal isolates