中国科技大学课件系列:《生物信息学》02复习过程.ppt

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生物信息学 ;中心法则;碱基;核苷酸,Ribonucleotide ;脱氧核苷酸 Deoxyribonucleotide;双脱氧核糖核苷酸 Dideoxyribonucleotide ;DNA的结构;RNA的结构;氨基酸的结构;氨基酸的性质及分类;氨基酸周期表;标准密码子;本章内容提要;1. DNA测序;;;;使用寡核苷酸引物连续测序;基因组测序:两种方案策略;人类基因组计划;;大规模测序方法;2. 序列数据的存储;核酸数据库数据的增长;GenBank;GenBank中测序最多的20个物种;EMBL核酸序列数据库;NIG (National Institute of Genetics) CIB (Center for Information Biology) http://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html ;INSDC;三大数据库之间的联系;RefSeq数据库;;RefSeq记录的特征;GenBank VS. RefSeq;dbEST: 表达序列标签数据库;UniGene: An Organized View of the Transcriptome;Swiss-Prot TrEMBL ;TrEMBL vs. GenPept;PIR;UniProt;UniProtKB;Swiss-Prot Release 57.7;TrEMBL Release 40.4;较早的基因组数据库- GDB;基因组数据库;The Ensembl project produces genome databases for vertebrates and other eukaryotic species, and makes this information freely available online. EMBL-EBI和Sanger研究所共同开发。 /;3. 序列数据的文件格式;DNA代码;GenBank数据文件格式;GenBank数据文件格式;GenBank数据文件格式;GenBank的数据类型;GenBank数据文件格式;GenBank数据文件格式;EMBL(UniProt)数据格式;EMBL和GenBank数据格式的对比;FASTA格式;FASTA格式

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