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Canoco for Windows 4.5 之 CCA 排序 以下为软件使用的详细步骤，具体探讨如何使用 Canoco for Windows 4.5 软件包完成 Canonical Correspondence Analysis (CCA) 分析， 软件包的大部分程序都将在步骤中涉及， 鉴 于分析中所采用的公用数据集， 大家可以基于 Canoco 测试版重做这些分析。 (提醒： Canoco 测试版默认安装路径为 C:\Canoco ，如果您在别的地方重新安装， 请恰当的调整文件夹路径。 ) 步骤共划分为四个过程 : 借助 WCanolmp 导入电子表数据 借助 Canoco for Windows 进行 CCA 排序 借助 CanoDraw 画出排序图 修正 CanoDraw 排序图 一、借助 WCanoImp 导入电子表数据 1.打开路径 C:\Canoco\Samples\dune_env.xls 中的 Excel 文件，当然也可以使用其他可读 形式。 在 Excel 表中， 要选择整个矩形区域的数据， 包括第一行 （含变量名称） 和第一列 （含 样本名称），然后复制数据到剪贴板（也可使用 Excel 中的 Edit →Copy 菜单命令） ，之后， 从快捷菜单中打开 Canoco for Windows 的子菜单 WCanoImp （见图 1）。 图 1 从快捷菜单中打开 WCanoImp 2.此时， WCanoImp 程序已经开始运行，这里我们选择保存数据为 Condensed 格式（如 果数据包括很多 0 值的话，而且这对于物种数据还很常见，那么浓缩格式可以节省文件空 间）。核对以下选项后，就可以点击保存按钮了（见图 2 ）。 图 2 WcanoImp 的文件保存 3. 此时出现一个文件选择框，选择文件路径为 C:\Canoco\Samples ，同时输入文件名 duneenv2.dta，此时不要输入 duneenv.dta，因为这个文件已经存在，如果你保存的话将会覆 盖（当然前提需要你的确认） ，之后，点击“ Save”按钮。 4. 之后弹出一个小型窗口，可以输入一段描述性的文字（最多 80 字节），此时由 WCanoImp 生成的一段文字被突出显示（蓝色阴影） ，可以默认，也可以通过输入文字直接 替换。 然后点击 “OK ”按钮， 有提示框提醒 “你的文件成功创建 ”，最后再次点击 “OK ”按钮后， 又回到 WCanoImp 窗口，可以关闭。 二、借助 Canoco for Windows进行 CCA 排序 1.从快捷菜单中打开 Canoco for Windows 的子菜单（见数据导入第 1 个步骤），此时选 择 Canoco for Windows 项，打开的时候会有日期提醒（已转换系统日期的除外） ，关闭后继 续。此时， Canoco for Windows 的工作区还是空的，在开始分析之前，我们必须创建一个新 的项目，如可以通过工具栏上的 “New project ”快捷键创建（图 3 ）。 图 3 Canoco for Windows 新项目的创建 2.点击 “New project ”按钮之后，会出现新的项目窗口（ Project View ）和登录窗口（ Log View ），同时项目建立向导也会自动启动（以下主