结构生物学简介、发展趋势和研究方法.ppt

PDB Current Holdings Breakdown（ Feb-27- 2007） Tuesday Sep 04, 2007 结构生物学的发展趋势 战略性重要地位 结构基因组学领域的国际协作 实现快速、自动、批量结构测定，复杂结构和动态过程研究将成为热点 测定生物大分子复合物、细胞器及亚细胞器的三维结构是目前结构生物学中的主要发展方向 膜蛋白和糖蛋白 模式生物中蛋白质组成为重要的研究对象 与人类疾病相关的蛋白成为主要的研究对象，查明“构象病”的结构机理，开辟防治相关疑难病症的新途径 批量发现药物靶标，基于结构的理性药物设计渐成创新药物主流 结构生物学发展趋势有如下特点 结构研究的兴趣由水溶性球蛋白进入攻克疏水的膜蛋白结构 结构研究已由单一分子进入分子间相互作用的复合物以及由许多 分子所构成的复合体，乃至分子机器 国际上很多难度高、意义重大的三维结构均是在近十来年突破的 结构生物学的研究成果已渗透到生命科学的各个领域 以蛋白质晶体学为主要手段，加以NMR方法的不断突破，生物大分子三维结构测定在高速发展 以蛋白质晶体学为主要手段，加以NMR方法的不断突破，生物大分子三维结构测定在高速发展 测定结构速度：　 1997-1998 平均每日 ~ 2 个结构 2001-2002 平均每日 ~ 8 个结构 当前 平均每日 ~15 个结构 以结构生物学三大实验手段统计： 晶体衍射 30,306 NMR 5,314 电镜三维重建 117 2006年4月1日PDB的公布 已释放原子坐标的结构共 35,813 套 其中 蛋白质、多肽和病毒 32,724 核酸 1,585 蛋白与核酸复合物 1,471 多糖 33 结构生物学的研究成果 已渗透到生命科学的各个领域 当前，为了定量地阐明有关的生物学机理——结构和功能关系，生命科学各领域的研究都尽最大可能地运用生物大分子三维结构的研究结果。 国际著名期刊《Cell》、《Science》、《Nature》、《J. Mol. Bol》、《J. Biol. Chem.》等刊登与结构生物学有关的论文与日俱增，而1991年创刊的 《Molecular Structure》和《Current Opinion Structural Biology》，1993年创刊的《Structure》以及1994年创刊的《Nature Structure Biology》等重要国际期刊几乎全部都是刊登结构生物学的最新研究成果。除此之外，另一些重要刊物虽然不用结构生物学为名，但所刊登的论文也主要与结构生物学密切相关，如《Protein Science》、《Biological Macromolecules》、《Structure and Dynamics》、《Protein》、《Structure、Function and Genetics》等。这既反映着整个生物学的发展态势，也表明结构生物学在当前和未来生命科学中的重要地位。 国际上很多难度高、意义重大的三维结构均是在近十来年突破的 细菌视紫红质 (bacteriorhodopsin) (1990, J.M.B.电子晶体学) 人免疫缺乏性病毒蛋白酶 (HIV protease) (1990, Science) CD4 (水溶片断) (1990, Nature) 类人猿病毒40 （simian virus 40） (1991, Nature) 人生长激素与受体复合物 (human growth hormonereceptor complex) (1992, Science) 口蹄疫病毒 (foot and mouth disease virus) (1993, Nature) 高等植物光合作用系统I (system I of photosynthesis, PSI) (6? 1993, Nature) 细胞色素c氧化酶 (Cytochrome c Oxidase) (牛心2.8?, 1995, Science 细菌2.8?, 1995, Nature) ATP酶的F1 (F1-ATPase) (牛心线粒体2.8?, 1994, Nature) 伴侣蛋白GroEL (chaperonin GroEL)