scifinder的使用物质检索与反应检索供参考.doc

徐 斌 2014.04 SciFinder Web 中的几个主要数据库 SciFinder 中的文献、物质、反应可以方便地 互相链接 Chemical Structure 结构检索 Markush Markush 检索 Molecular Formula 分子式检索 Property 性质检索 物质检索模块 Substance Identifier Substances 物质标识符检索 结构检索 三种检索类型 需安装 无插需件安装 插 JAVA JAVA 件，直接绘图， 部分功能无法开 启，不影响正常 使用 导入已经保存的文件 SciFinder 结构绘制工具 添加工具，通过外部标示符文本框填写 登录号或 CAS SMILES InChI 或 字符串，将外部结构添加至编辑器 例如： CAS RN 461432‐26‐8 Smiles [C@H]1([C@H]([C@@H]([C@H](C(O1)c1ccc(c(c1)Cc1ccc(cc1)OCC) Cl)O)O)O)CO InChI 1S/C21H25ClO6/c1‐2‐27‐15‐6‐3‐12(4‐7‐15)9‐14‐10‐13(5‐8‐ 16(14)22)21‐20(26)19(25)18(24)17(11‐23)28‐21/h3‐8,10,17‐ 21,23‐26H,2,9,11H2,1H3/t17‐,18‐,19+,20‐,21?/m1/s1 结构检索有三种类型 z 精确结构检索： 母体结构不能修改，不能修饰，可获得物质的盐，聚合物， 混合物，配合物等 z 亚结构检索： 获得母体结构的衍生结构，所画的结构必须存在，母体结构 不能修改，但可以被修饰 z 相似结构检索： 获得相似度在60分以上的结构，母体结构可以修改，也可以 被修饰，用相似度来控制获得的结果 三种类型检索的比较 检索类型 能检索得到的结果 不能检索得到的 结果 Exact Search 完全相同结构检索 （精确结构检索？） 与检索的结构完全相同，以及其多元 物质 （盐、聚合物、 化合物） 互变异构体 (Tautomers) 含取代基的物质 与检索的结构完全相同，以及其多元 结构相似， 但并不是 Substructure Search 亚结构检索 物质 （盐、聚合物、化合物） 互变异构体 (Tautomers) 含取代基的物质 其亚结构，如乙基 （甲基的结果便不会 出现） 与检索的结构完全相同，以及其多元 物质 （盐、聚合物、化合物） 有相似结构的物质, 但其元素成份、 Similarity Search 相似结构检索 取代基和其位置与检索的结构不同两 者的结构相似，但并不是其亚结构， 如乙基 （甲基的结果便不会出现） 物质含有的环数目和检索的结构不同 结构有较大的取代基 （相似程度低） （输入 6 – 5 环的结果） 环时， 有可能获得 6 – 6 三种检索的相互关系 思考： 精确检索可被亚结构检索完全覆盖，为 何其没有被相似检索完全覆盖？ 结构检索的一般过程 画出结构式 选择检索类型 添加限定条件 ( ) 可选 执行检索 ?点击 将.cxf ?点击Show 或.mol格式的文 Precision analysis 可获取和所检结 构相关的异构体 （除立体异构之 外）等分类选项 献导入 ?点击 将CAS号 SMILES/InChI转 换成结构式 ?将Chemdraw或 ?限定物质是否 ISISDraw的结构 为单一组分、是 式直接 否有商业品来源、 copy/paste 是否有文献报导， ?直接画入结构 物质的类别、涉 式 及的研究方向 ? Markush 检索 直接检索和结构有关的专利，用于做初步的专利评估 Markush 结构 Markush, E. A., US 1506316 August 26, 1924 主要用于化学领域的马库什权利要 求或结构是一种在一个或多个部分 的化合物中具有多种“功能等同” where R is a group selected from ... 的化学成分的权利要求。马库什权 利要求根据尤金 马库什而得名。 ? 他是于 年代第一个在美国专利 1920 中成功使用这种权利要求的发明人。 SciFinder Markush 中的 检索 1.SciFinder Markush 的用户对于专利信息的需求逐渐增大， 检索是对 的一个补充，能检索到通过结构检索不 到的专利。 REGISTRY 2. Markush 检索通过预先设定一些检索参数，提供了简易 的 检索。 MARPAT 3. Markush Markush 检索会给出一类相关的 结构相关的专利 文献，可用于专利全景的初步评估。 思考：同一化合物结构在 检索中获 得的结果与其在文献检索中的