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建模与仿真及其医学应用
生物医学工程专业用
概论
? 面向21世纪教学的信息学与生命科学交叉课程
? 多学科综合交叉的科学,随着信息技术、系统
技术、计算机技术的发展,建模与仿真已成为分
析、研究和设计各类系统,特别是复杂系统和大
系统的有力工具。
? 生命系统是最复杂的系统,因此建模和仿真及
其在医学中应用是本世纪生物医学工程专业需要
掌握的基本知识,
? 学习本课程应有相应的数学基础和信号与系统
等基础知识。
本课程内容
1.基础理论部分
2.建模与仿真的MATLAB实现
3.在生命系统中应用的典型范例
本课程 学时,其中:
72
理论讲授 学时
54
实验(建模与仿真的计算机实现) 学时
18
1.基础理论部分
共5章,包括:
第一章(建模与仿真概论)
第二章(系统的数学模型和建模方法)
第四章(连续系统的数字仿真)
第五章(基于实验数据的建模与仿真)
第六章(建模与仿真的校核、验证和确认)
2.建模与仿真的 实现
MATLAB
共包括两章及附录,包括:
第三章(系统建模的MATLAB实现)
第七章(系统仿真的MATLAB实现)
附录(MATLAB基础)
是建模与仿真计算机实现的实际教学环节
在生命系统中的典型应用
? 单一种群生态系统微分方程模型
? Hodgkin-Huxley方程,
? 房室模型,
? 基于观测数据的生物系统建模与仿真。
希望通过第三部分的教学,以点带面,
启发学生应用建模与仿真的基本理论和方法,
去研究生命系统的思路和实施路线。
第一章 概论
?
系统模型的定义、分类
?
系统仿真的基本概念、基本步骤、分类和
计算机仿真
?
系统仿真的应用概述
?
生物医学系统的建模与仿真概述与发展趋势
第二章
系统的数学模型和建模方法
? 数学模型的分类
? 数学模型建模基本方法:
? 建模过程的信息源、建模方法、过程、模型可信度
? 连续系统模型:连续时间模型和离散时间模型
? 离散事件模型概论
?
数学模型之间的转换
(重点为:外部模型到内部模型的转换)
? 外部模型转换为内部模型的最小实现问题简介
第三章
系统建模的MATLAB实现
?
学习和掌握MATLAB基本知识
?
掌握数学模型的MATLAB基本实现:
时域模型、状态空间模型和零极点模型
?
掌握MATLAB实现系统的转换、连接
?
了解模型降阶及其MATLAB实现
第四章
连续系统的数字仿真
? 数值积分法原理和数值积分法的选择原则
?
离散相似法
? 数值积分法和离散相似法在仿真中的应用
?
两种方法应用范围和讨论
第五章
基于实验数据的建模与仿真
? 实验数据建模与仿真概念
? 模型参数估计
? 最小二乘法
? 线性回归数学模型
? 非线性回归模型
? 实验内容: 应用实验数据
1、应用最小二乘法进行模型参数估计,
进行多项式拟合的Matlab实现
2、建立回归模型,对所建模型进行回归分析 。
第四章
建模与仿真的校核、验证与确认
?
VVA技术的基本概念、过程
? 模型校核:系统仿真误差源校核、程序校核。
? 模型验证:谱分析法、置信区间法、
假设检验法、动态关联分析法
? 仿真模型的确认:一般观点、确认的步骤
?
系统仿真结果统计分析:
蒙特卡洛法、CADFT法思路
第七章
系统仿真的MATLAB实现
?
学习计算机仿真的步骤。
?
数值积分法的MATLAB实现和基于数值积分法的
连续系统的数字仿真。
?
基于离散相似法的连续系统仿真。
?
SIMULINK动态仿真:
SIMULINK窗口及模型库、系统框图模型的建立、
系统仿真运行、仿真结果输出、子系统创建及
封装。
第八章
生命系统建模与仿真的典型范例
? 通过四类生命系统建模与仿真的范例,
学习对生命系统建模和仿真的思路
以及解决实际问题的基本方法。
? 着重学习的是“方法论”,
而不仅仅是对某些具体问题的建模和仿真。
? H-H方程和房室模型是要重点掌握的两类模型
第八章 教学内容
? 单一种群生态微分方程模型:
Malthusian方程和 Logistic方程。
? 电神经生理数学模型—Hodgkin-Huxley方程:
神经细胞兴奋和兴奋传递的数学描述、
Hodgkin-Huxley模型的等效电路图、
Hodgkin-Huxley方程的电导测定、
Hodgkin-Huxley方程的成功应用和重大意义。
? 房室模型的建模与仿真:
房室模型简介、建立房室系统模型的基本原则、房室模型
建模实例。
?
基于生物系统观测数据的建模与仿真、系统辨识。
谢谢大家
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