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HPC应用领域概述 新兴 HPC应用 生命科学 动漫渲染 金 融 游戏产业 移动医疗 区域计算中心 传统 HPC应用 石油石化 科研教育 气象地震 制造CAE 国防军工 网格计算 ., HPC应用领域概述 生命科学 （基因排序、蛋白质折叠） 计算化学 （量子化学、材料模拟） 分子动力学 （分子运动模拟、可视化） CFD CAE （流体动力学、计算机辅助工程） 气象环境 （数值气象预报、环境污染监测） 渲染可视化 （动漫渲染、影视制作） 石油天然气 （油藏模拟、地震模拟） 计算数学 （算法开发、数据可视化） ., 生命科学领域软件简介 生命科学 生命科学是研究生命现象、生命活动的本质、特征和发生、发展规律，以及各种生物之间和生物与环境之间相互关系的科学。 研究内容 基因组信息学 蛋白质空间结构模拟与预测 药物分子设计 基因表达的调控；基因功能的预测；芯片表达；数据分析等。 分子的进化、生物的起源 ., 生命科学领域常用软件 生命科学(基因排序、 序列比对、分子对接) BLAST/ MPIBLAST BLAST是现在应用最广泛的序列比对软件（基因两两比对）和序列相似性搜索工具. FASTA FASTA是第一个被广泛应用的序列比对和搜索工具包，包含若干个独立的程序。 CLUSTAL CLUSTAL是多序列比对软件 DOCK 是目前应用最广泛的分子对接软件之一 生命科学领域软件简介 ., 生命科学领域软件简介 序列对比软件BLAST BLAST是现在应用最广泛的序列相似性搜索工具，用于序列两两比对，由NCBI研制。BLAST系统对于生物基因序列数据在计算机中的表达和处理作了许多的研究，建立在严格的 统计学基础之上。由于功能强大，检索速度快，? BLAST流行于世界上几乎所有的生物信息中心。 现在已有并行版本的BLAST，mpiBLAST，具有几 乎线性的加速比。对于BLAST的并行化，实际上是 将整个基因数据检索空间分成若干个子空间，为每 个查询节点分配一个子空间，最后将查询结果汇总 到主节点进行结果的输出。 ., 生命科学领域软件简介 序列对比软件BLAST ., 计算化学 计算化学领域软件简介 ., 计算化学领域软件简介 计算化学领域常用软件 Gaussian03 Gaussian是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件 Dacapo DAPACO是基于密度泛函理论计算总量的程序。 Geomos 半经验量化计算软件，可以使用大多数当前的半经验方法。 Material studio 专为材料科学领域开发的新一代材料计算软件 ., XP, 2000, 2003, Vista, 2008 计算化学领域软件简介 Material Studio Materials Studio是Accelrys专为材料科学领域开发的新一代材料计算软件，可帮助研究人员解决当今化学及材料工业中的许多重要问题。 Materials Studio软件采用Client-Server结构， Microsoft标准用户界面，不需要登录服务器。客户端可以是Windows 98、2000或NT，计算服务器可以是本机的Windows 2000或NT，也可以是网络上的Windows 2000、Windows NT、Linux或UNIX。 ., Material Studio的特点： 多种先进算法的综合运用使Material Studio成为一个强有力的模拟工具。无论是性质预测、聚合物建模还是X射线衍射模拟，我们都可以通过一些简单易学的操作来得到切实可靠的数据。灵活方便的Client-Server结构还是的计算机可以在网络中任何一台装有NT、Linux或Unix操作系统的计算机上进行，从而最大限度的运用了网络资源。 可以在Windows 98,Me，NT，2000 和XP 下运行。用户界面符合微软标准，你可以交互控制三维图形模型、通过简单的对话框建立运算任务并分析结果 如果你安装了Materials Studio 的其它模块，后台运算既可以运行在本机，也可以通过网络运行在远程主机上。这取决于你建立运算时的选择和运算要求 Materials Studio采用了大家非常熟悉Microsoft标准用户界面，它允许你通过各种控制面板直接对计算参数和计算结构进行设置和分析。 计算化学领域软件简介 ., 分子动力学 分子动力学模拟是通过求解系统中所有粒子的运动方程来得到粒子的运动轨迹。在模拟中，粒子间相互作用的计算占用了大部分机时，不同的粒子间势能模型需要的计算时间是不同的，其中势能函数随距离衰减的速度是一个重要的影响因素。 分子动力学领域软件简介 .