中科大MS用CASTEP如计属表面上的吸附能.ppt

注意，不能用中文建目录。 计算结果要及时保存。 CO 吸附在 Pd （ 110 ）面 目的： 介绍用 CASTEP 如何计属表面上的吸附能。 模块 ： CASTEP ， Materials Visualizer 背景知识： Pd 的表面在许多催化反应中都起着非常重要的作用。 理解催化反应首先是弄清楚分子是如何与这样的表面相结合的。 在本篇文章中，通过提出下列问题， DFT （密度泛函）模拟有 助于我们的理解：分子趋向于吸附在哪里？可以有多少分子吸 附在表面？吸附能是什么？它们的结构像什么？吸附的机制是 什么？ 我们应当把注意力集中于吸附点 , 既短桥点，因为众所周知它 是首选的能量活泼点。而且覆盖面也是确定的 (1 ML). 。在 1 ML 覆盖面上 CO 分子互相排斥以阻止 CO 分子垂直的连接在表面上。 考虑到 (1x1) 和 (2x1) 表面的单胞，我们将要计算出这种倾斜对化学 吸收能的能量贡献。 绪论 : 在本指南中，我们将使用 CASTEP 来最优化和计算数种系 统的总体能量。一旦我们确定了这些能量，我们就可以计算 CO 在 Pd(110) 面上的化学吸附能。 本指南包括： 1 ．准备项目 2 ．最优化 Pd 3 ．构造和优化 CO 4 ．构造 Pd(110) 面 5. RELAXINGPd(110) 面 6 ． 添 加 CO 到 1x1Pd(110) ， 优 化 此 结 构 7 ．设置和优化 2x1Pd(110) 面 8 ．分析能量 9 ．分析态密度 1 ．准备项目 选一路径，建立一个 CO-Pd 文件夹。然后按下列操作， 在 CO- Pd 文件夹中生成 CO-Pd 的 Project 。 本指南包含有五种明显不同的计算。为便于管理项目，我们 先在项目中准备五个子文件夹。在 Project Explorer 的根图标上右 键单击，选择 New | Folder 。再重复此操作四次。在 New Folder 上 右键单击，选择 Rename ，键入 Pd bulk 。在其它的文件上重复此 操作过程，把它们依次更名为 Pd(110) ， CO molecule ， , (1x1) CO on Pd(110) ， 和 (2x1) CO on Pd(110). 2 ．最优化 bulk Pd Materials Studio 所提供的结构库中包含有 Pd 的晶体结构。 在 Project Explorer 中，右键单击 Pd bulk 文件夹并且选择 Import.... ， 从 Structures/metals/pure-metals 中导入 Pd.ms i 。 显示出 bulk Pd 的结构，我们把显示方式改为 Ball and Stick 。在 Pd 3D Model document 中右键单击，选择 Display Style ，在 Atoms 标签中选择 Ball and Stick ， 关闭对话框 。 现在使用 CASTEP 来优化 bulk Pd 。 从工具栏中选择 CASTEP ， 再选择 Calculation 或菜单栏 中选择 Modules | CASTEP | Calculation 。 CASTEP 对话框如下： 把 Task 从 Energy 改为 Geometry Optimization ，按下 More... 按钮， 在 CASTEP Geometry Optimization 对话框中选中 Optimize Cell 选 项。按下 Run 键。出现一个关于转换为原胞的信息框，按下 OK 。 工作递交后，开始运行。结束后出现如下信息。 工作完成后，我们保存项目，选择 File | Save Project 。然后在 Project Explorer 中打开位于 Pd CASTEP GeomOpt 文件夹中的 Pd.xsd ，显示的即为 Pd 优化后的原胞结构。由下面步骤恢复 Pd 优 化后的晶胞结构。 在左侧的 Properties 中选择 Lattice 3D ，从中可以看到优化后的 晶格参数大约为 3.95 ? ，其而其实验值为 3.89 ? 。 现在我们应该进行下一步操作，构造 CO 分子。 3 ．构造和优化 CO CASTEP 只能处理周期性的体系。为了能够优化 CO