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蛋白质与酶分子的设计与改造 配体和受体的分子对接实验 第5小组 配体和受体的分子对接实验 就是通过计算机及相应的软件来模拟受体与 配体的分子对接过程,以及结果的分析 令 AUTODOCK是用于分子对接的软件,可以给 出可能的构象,进行簇分析,给出对应的结 合能等。 ÷ autodocktools是 autodock的前处理图形化界 面,主要是用来完成配体,受体和对接区域 选择的准备工作。 软件的下载和安装 软件的下载! p edu/downloads/autodockregistration /mgltools. scripps. edu/download AutoDock a ntococlt G autodock. 2.3 win32 autori dt AutoDockTools(ADT) MGLTools-1, 5. 4-S 必须安装在c盘 ADT( autoducktools主界面: 1.PMV菜单:主要通过使用菜单命令对分子进行相关操 作,以及进行可视化设置 2.PM工具栏:PM菜单中一些常用命令的快捷按钮 3.ADT菜单: Auto Grid和 AutoDock的图形化操作菜单 4.分孑显示窗口:3D模型分子的显示和操作窗口 5.仪表板窗口部件:快速查看及设置分子的显示模型及着色方式 5.信息栏:显示相关操作信息