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基因与蛋白质组学数据分析
实验四:蛋白质序列、结构的获取和显示
杜娟
dujuannx@126.com
实验项目四:蛋白质序列、结构的获取和显示口
、实验目的和要求:
掌握蛋白质序列数据库 Uniprot的査询方法
及格式特点
掌握蛋白质结构数据库PDB的及格式特点
·掌握蛋白质结构显示软件 Pymoll的使用
UniPro数据库
简介
UniProt: Universal Protein Resource
收录蛋白质序列目录最广泛、功能注释最全
面的数据库
包含三个子库:
UniProtKB (UniProt Knowledgebase)
UniRef (Uni Prot Reference Clusters)
UniParc (Uniprot Archive)
2.数据来源。
UniProt
EMBL-EBI
SIB
Europea
Protein
SIB Swiss
Institute(EMBL
Institute of
esource(PIR)
Bioinformatics
Swiss-Prot and TrEMBL
Protein Sequence
Database(PIR-PSD)
UnIPro
The mission of uniProt is to provide the scientfic com munity with a comorehensive, high-quality and freely accessib
UniProtKB
UniRef
UniParc
Proteomes
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sequence archive
个
Swiss-Prot(549.008)
Supporting data
TrEMBLerature cratons
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Keywords
I tewe
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You Tube UniProt data
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