生物信息学基础课件.ppt

(2) 药物基因组学 1 ） 问题的提出： 不同的病人对同一种药物有不同的反应。 药物基因组学可以运用大范围系统的基因组技术，找出与药 物作用有关的基因。在基因水平上设计，避免病人服用无效、 低效的药物，从而结束单一处方的时代。带来突破性的革命。 2 ）药物基因组学与遗传多态性 药物基因组学正是从基因水平揭示这些差异的遗传特征，鉴 别基因序列中的差异。用更科学的手段看病开药，即依照病人 的基因组特征优化药疗方案。 药物基因组学需要检测基因序列中差异的位置，碱基位置的 置换，确定一个基因中多种差异的相对位置等。 3 ）药物基因组学与药物开发的未来 药物基因组学提供了能被检测的全新的基因范围 — 药物应答 基因，所以利用药物基因组学可以实现药物的目标化。 例子： Novatis 公司的精神分裂症药 -- 氯氮平，是治疗精神分裂症药的首 选药，但 1% 的病人服用后会得一种危及生命的病 — 粒细胞缺乏症。从而 大大影响了市场。如果通过药物基因组学的研究，检测出粒细胞缺乏症的 药物应答基因，将大大拓宽市场。另外在药物进入临床时，清楚了相关的 药物应答基因，对受试人群进行基因分型，可以准确地知道该种药物适合 哪些病人。 有关药物作用的遗传影响与生物反应的变异性的信息将在新 药的设计、发现和成功开发方面起重要作用。 美国 NIH 于 1998 年计划建立一个药物基因组学数据库，搜集 “个体”基因及其功能的资料，以便于药物的开发。 1997 年以 来，已经有几十家药物公司进入药物基因组学领域。有人估计， (3). 药物分子设计 1). 新药研制的四类方法 2). 基于作用机理（受体结构）的药物分子设计 Structure based drug design ( or Rational drug design) 3). 基于作用机理（受体结构）的药物分子设计的一 般步骤 7. 4. 3 é ú ? ? D ? ? ￠ ? § ￡ ¨ μ ° ° × ? ê ? á 1 ￡ ? ? D ? ? ? D ? - 3 ￡ ê 1 ó ? μ ? ? ? ? ê y à í · ? · ¨ 7. 4. 3. 1 é ú ? ? D ? ? ￠ ? § μ ? ? D D ? è ? ? ? ? ù ? Y · ? × ó é ú ? ? ? § μ ? ? D D ? · ¨ ? ò ￡ ? ? D ? ? é ú ? ? ′ ó · ? × ó ￡ ¨ D N A , Pr ot ei n μ è ￡ ? μ ? ? á 1 o í 1 | ? ü ? ￠ ? à ? ￥ × ÷ ó ? ò ? ? ° ò ? ′ ? D ? ? ￠ μ ? ′ ? μ Y ￡ ? 2 ? ? ÷ é ú ? ü ? ? ? ˉ μ ? ± ? ? ê ? ￡ 7. 4. 3. 2 é ú ? ? D ? ? ￠ ? § μ ? ? D ? ? · ? · ¨ ? é ò ? · ? ? a á ? à à ￡ o ( 1). ò ? · ? ? ? ? a ? ÷ ￡ ? è ? D ò á D · ? ? ? ? ￠ ? ù ò ò × é × ÷ í ? ? ￠ ? ù ò ò ? ¨ ? ? μ è ? ￡ ( 2). ò ? × ? o ? ? a ? ÷ ￡ ? ò ? ? ? ? ü ? § ? ? ? a ? ? μ ? ￡ ? ? D ? ? ? à ? · ? × ó ? ? ? ? μ ? ? à ? ￥ 1 ? ? μ o í ? à ? ￥ × ÷ ó ? ￡ ? ′ ó ? ? ì ? é ? 1 ? 2 ì ? ￠ ? μ í 3 μ ? ? D ? ? · ? × ó é ú ? ? ? § ? ê ì a ? ￡ è ? ? ? ° ? μ ÷ ? ? ? ú à í ? ￠ D ? o ? ′ ? μ ? ? ú à í μ ? ? D ? ? ? ￡ 7.4.4 序列比对 序列比对的进化基础 图 7.1 、保守位点通常在功能上极为重要。对老鼠的胰蛋白酶（ Swiss-Prot P07146 ）和小龙虾的胰 蛋白酶（ Swiss-Prot P00765 ）作比对，