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中国地质大学（武汉）高性能计算HPO程报告 中国地质大学研究生课程论文封面 课程名称 高性能计算 教师姓名 研究生姓 名 研究生学号 研究生专业 软件工程 所在院系 信息工程 学院 类别：A.博士 VB.硕士 C.进修生 日期: 20XX年1月9日该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 评 语 对课程论文的评语: 平时成绩： 总成绩： 课程论文成绩： 评阅人签名： 注：1、无评阅人签名 成绩无效； 2、 必须用钢笔或圆珠笔批阅，用铅笔阅卷无效； 3、 如有平时成绩，必须在上面评分表中标出，并计算 入总成绩。 高性能计算在三维地质建模上的应用 一、应用背景 随着地学信息化的发展，数学地质正向“数字地质”发 展。三维地质建模软件将是“数字地质”的精髓与核心。三 维地质建模是指采用适当的数据结构，在计算机中建立能反 爱心—用心—怛心该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 映地质构造的形态和各要素之间关系以及地质体物理、化学 属性空间分布等地质特征的数学模型。相比传统的平面图、 剖面图，三维地质模型有显示直观、空间分析功能强大、对 原始数据可以直接检查等特点。该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 于三维地质建模涉及钻孔数据、剖面数据、三维地震资 料等多种数据源，并且地质建模从二维转向三维数据虽急剧 增大，涉及较为复杂的计算过程，单台电脑的计算能力已经 逐渐满足不了相应计算与存储的要求。三维地质建模上的应 用主要为通过各种地质数据源反演计算出易于分析和表达 的三维GIS规则体元模型。对当前主流高性能计算技术进行 了总结，并对比了几种可选的技术方案。该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 高性能计算主要解决以下几个方面的问题： 1） 大规模矩阵的运算。于获取地质源数据H:的增大， 地质数据进行反演计算的过程中会出现上万阶甚至更大的 矩阵，这些矩阵的运算需要较长的时间甚至直接超过单台主 机的内存容虽。该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 2） 计算代码并行。在生成三维的规则体元数据时，需 要对数据进行一定的插值，计算各个体元的属性值。地质体 生成的三维体元数据对精度的要求较高，导致大虽耗时的计 算。该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 3） 存储管理。反演计算后模型采用三维体元数据的形 式进行存储，需要占用大虽的存储空间，合理进行分布式的 存储有利于后期的分析，并增加数据读取的速度。该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 二、可采用技术 MPI MPI(Message Passing Interfaee) 是一个消息传递接口该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 的标准，MPI不是一门编程诺言，而是一个库，可以被 C、 C++、FORTRAN编程语言调用。从语法上说，它遵守所有语 言对函数的调用过程，和一般的函数没有什么区别。 通过MPI 可以实现多个主机之间进程的通信，达到集群计算的目的。该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 MPI具有良好的移植性和可扩展性、完善的异步通信机制、 众多厂商的支持并且易于使用。该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 在linux 环境下，常用的 MPI库为 MPICH和OpenMPI 低版本可以在 windows上使用。最新的 MPI标准在20XX年 6月发布，不支持容错性，预计两年后发布的 MPI支持新该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 的容错性。 在windows环境下，推荐使用微软为高性能计算开发的 MS-MPI。20XX年11月发布当前最新的版本， 相比之下MPICH 与OpenMPI都在20XX年停止了对 windows的更新，只能通 过安装linux虚拟运行环境使用。微软专为 windows开发了该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 一套高性能集群计算的库 Microsoft HPC Pack ，通过 HPC该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 Pack可以使用一台装有 windows server 系统的电脑做为主 节点进行MPI任务的管理，其余电脑作为计算节点进行计算。该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 CUDA CUD濯显卡厂商NVIDIA推出的并行计算平台和编程模 型，专为NVIDIA显卡进行计算加速而设计，通过更为简单 的模型提高了显卡并彳丁运算的易用性。在高性能计算领域，该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 GPU勺计算能力远高于 CPU最新的NVIDIA专用于科学计算 的显卡TESLAK80的双精度性能将近 3TeraFLOPS,内存总带 宽高达480GB/S。该文档为文档投稿赚钱网作品，版权所有，违责必纠 CUDA Toolkit为C++