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组织DNA与RNA的分离和提取
一、实验材料
1.器材 手术器械、匀浆器、台式微量高速离心机、微量加样器、振荡器、水浴锅。
2.试剂 (1)0.14mol/L NaCl-0.01mol/L EDTA:称NaCl 8.18g、乙二胺四乙酸二钠盐3.72g,加蒸馏水溶解,调pH至7,稀释至1000ml,贮放冰箱中;(2)25% SDS:称取十二烷基硫酸钠25g,溶于50%的乙醇中至100ml,室温存放;(3)2mol/L NaCl:称11.7g NaCl,用蒸馏水配置成100ml溶液;(4)氯仿-异戊醇:氯仿24份与异丙醇1份混匀;(5)80%酚:取苯酚80份,加蒸馏水20份,混匀后装棕色瓶中;(6)0.05mol/L醋酸缓冲溶液(pH 5.0):0.5mol/L醋酸钠35ml,0.2mol/L醋酸15ml,加蒸馏水稀释至1000ml,混匀后测pH应为5.0;(7) 2mol/L醋酸钠:取无水醋酸钠16.4g,用蒸馏水溶解后配成100ml;(8)95%乙醇。
二、实验操作
1.组织DNA的分离提取
(1)小鼠剪短颈动脉,放血处死,开腹取其脾及两肾(约0.3g),浸入预冷至0℃
(2)将组织剪碎,转入玻璃匀浆器中,加入0.14mol/L NaCl-0.01mol/L EDTA液7ml,旋转上下匀浆,至绝大部分细胞破碎为止。
(3)2500r/min离心15min,吸去上层液体,向沉淀中再加入0.14mol/L NaCl-0.01mol/L EDTA混匀,离心洗涤之(如欲获得RNA含量极少的纯DNA时,此步离心洗涤应重复多次)。
(4)经洗涤后的沉淀,加入3ml 0.14mol/L NaCl-0.01mol/L EDTA,在搅拌下缓缓滴入25% SDS 0.4ml,转入匀浆器内混匀,使沉淀悬浮均匀,再加入2mol/L的NaCl 4ml。此时,由于大部分脱氧核苷酸蛋白溶出,溶液粘度骤然升高,再匀浆一次使之均匀。
(5)转入三角瓶中,加等溶剂的氯仿-异戊醇约8ml,剧烈振摇10min,3000g离心10min,上层为水液,下层为氯仿,中间界面为变性蛋白质,吸出上清水液(如欲获得掺杂蛋白质较少的DNA,抽提和离心可重复多次,直至界面看不到变性蛋白质层为止)。
(6)上层水液边摇边加入等体积的95%乙醇,即可见有长纤维线状DNA析出,用玻棒搅拌,DNA及粘缠在玻棒上,瓶壁上尽量将水分挤干。
(7)缠在玻棒上的DNA纤维溶于1ml 0.1mol/L溶液中,待定量和电泳分析。
2.组织RNA的分离提取
(1)饥饿一天的小鼠,放血处死,解剖出肝,浸于预冷至0℃
(2)取0.3g肝,加入0.05mol/L醋酸缓冲液(pH 5.0)3ml、25%SDS 0.5ml,移入匀浆管,匀浆后加入等体积80%酚,再匀浆一次。
(3)移入三角瓶中,置65℃
(4)3000r/min离心10~15min,上层水相含有RNA稍浑浊,中层为变性蛋白质,下层为酚液,管底残喳中含有DNA。吸出上层水液(若要提高RNA的收获量,可向中下层液中再加入1/2体积的醋酸缓冲液,重复65℃水浴振摇、离心步骤,合并两次的上层水液)
(5)分别加入1/10体积的2mol/L醋酸钠、2.5倍体积遇冷的95%乙醇,混匀,于冷处放置至絮状沉淀充分形成。
(6)3000r/min离心10min,弃上清,离心管倒置于滤纸片上,尽量使液体流干。
(7)RNA沉淀用蒸馏水1ml溶解,待定量和电泳分析。
三、注意事项
1.DNA和RNA的提取操作应在4℃
2.手上有RNA酶,提取RNA时应戴手套,尽量避免RNA酶污染。
3.提取DNA时,需待纤维状DNA大分子充分析出后,再用玻璃棒将其缠绕出来。
Trizol法是利用RNA和DNA在溶液中分布不同将其分开,RNA分布在水相中,DNA分布在有机相中,用乙醇将DNA沉淀下来。
其它的DNA提取方法:酚抽提法、甲酰胺解聚法、TRIzol法详见《组织与细胞培养技术》第267页
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