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引物纯化方式 HAP、PAGE、DHLPC等的区别
纯化方式:
一 OPC 纯化
OPC 纯化是使用一种叫 Cartridge 的反向层析柱 (美国 Waters 公司生产 ), 根据 DNA保
护基 (DMTr 基 ) 和层析柱中树脂间的亲和力作用的原理进行纯化目的 DNA片段。OPC法纯化的
DNA纯度大于 90%,适用于 PCR用引物, DNA测序用引物,各种探针等。此级别对短链较为
有效。 具体操作方法如下。
1. DNA 合成是用全自动 DNA 合成仪从 3 ‘→ 5 ‘进行人工合成的。在刚合成完的 DNA 的
5 ‘端的碱基上带有一个 大型的疏水性保护基团 DMTr 基,而中间产物的短链杂质 DNA 中
不具有 DMTr 基。利用这一性质进行目的 DNA 的纯化。
2. 把粗样 DNA 加入 Sep-Pak Cartridge 柱上 (简易反相柱 ) 。此时, 所有的合成产物全
吸附于反相柱上。
3. 用甲醇清洗反相柱。 此时,吸附能力强的带有 DMTr 保护基的目的 DNA 仍吸附于反相柱
上,而短链杂质 DNA 片段全部被冲走。
4. 向反相柱上加入强酸 TFA (Trifluoroacetic acid) , 切断 DMTr 保护基和目的 DNA
之间的连接。
5. 再用乙腈洗脱目的 DNA 。此时回收出来的目的 DNA 的纯度能达到 95% 以上 。可用于
DNA 测序等。
二 PAGE纯化
PAGE 纯化法是使用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳, 对 DNA片段进行分离, 然后从凝胶中回收
目的 DNA的方法。 PAGE纯化法也是一种非常有效的 DNA纯化方法,纯化后的纯度大于 95%,
对长链 Oligo DNA 的纯化特别有效。适用于 PCR用引物, DNA测需用引物,各种探针等。
三 HPLC纯化
采用高效液相色谱纯化,产物纯度极高,可达 99%。适用于各种基因工程试验,特别是:
荧光标记 DNA、长链 DNA、 PCR克隆,定点突变,人工合成基因等。
HPLC 纯化
HPLC 纯化是使用高效液相色谱仪, 对目的 DNA 片段进行纯化的方法。 HPLC 纯化的设备投
资大,生产成本高,但使用本法纯化的 DNA 片段纯度极高,大于 99% 。 HPLC 纯化的操作
方法如下。
1. 合成高纯度级 DNA 制品时,在全自动 DNA 合成仪上,需自动脱去 DMTr 保护基。
2. 将粗样 DNA 注入分离性能极强的离子交换高效液相色谱系统, 进行粗检测, 确认主峰位
置、目的 DNA 含量等 。
3. 增加注样量,回收主峰平头部分。此时可达到去除杂质短链 DNA ,纯化目的 DNA 的目
的。 为了确保 DNA 的纯度,一般一次的纯化量为 1 OD 左右。
4. 将回收后的 DNA 进行纯度检测,确认纯度的可靠性。
。
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四 HAP
什么是 HAP?
HAP是英文 HIGE AFFINITY PURIFICATIION 的缩写。 HAP方法是生工自主开发的新型 oligo
DNA纯化方法。。用 HAP纯化的引物纯度可达 98%
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