基于叶绿体DNA分析的辽宁省梨属种质遗传多样性研究.pdf

园 艺 学 报 2014，41 （7）： 1307 –1316 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 基于叶绿体 DNA 分析的辽宁省梨属种质遗传多 样性研究 常耀军 1，曹玉芬 1,* ，张金梅 2，田路明 1，董星光 1，张 莹1，齐 丹 1， 郑迎春 1 （1中国农业科学院果树研究所，农业部园艺作物种质资源利用重点实验室，辽宁兴城 125100；2中国农业科学院作 物科学研究所，国家作物种质库，北京 100081） 摘 要：从 32对叶绿体 DNA 通用引物中筛选出 8对引物用于评价辽宁省梨属种质的遗传多样性， 其中4对引物所扩增的叶绿体 DNA 片段存在突变位点。合并后的叶绿体基因片段（ 3 688 bp）含有单一 突变位点 9个、简约信息性位点 3个以及插入 /缺失（ INDEL ）2个。在 37个样品中， trn L-t rnF-487区域、 trnL- trn F-413区域、 rbcL 区域和 trnS-psbC区域的单倍型分别为 2个、4个、 2个和 3个，合并之后的叶 绿体基因片段的单倍型为 4个。非编码区 trn L-trn F-413多态性最高，具有最高的单倍型数、最高的单倍 型（基因）多样性、最高的核苷酸多样性、最高的单倍型多样性方差和最高的单倍型多样性标准差。辽 宁省37份梨种质的单倍型（基因）多样性（ Hd ）、核苷酸多样性（ Pi ）分别为 0.577、0.00055。Tajima ’s D 检验中除了 rbcL 区域的 D值在 P 0.05水平上显著外，其余区域的 D值未达显著水平，表明自然选择对 rbcL区域的突变位点产生了作用。秋子梨和白梨种质共有单倍型 HAP_1、HAP_2和HAP_3 ，显示出一定 的亲缘关系；西洋梨则单独共享 HAP_5 。运用中介邻接网络（ Median-Joining network，MJ ）算法绘制的 中介网络图显示 HAP_1与HAP_2、HAP_3 的亲缘关系较远，而 HAP_5则与上述 3个单倍型的亲缘关系 较远。 关键词：梨；叶绿体 DNA ；单倍型；遗传多样性 中图分类号： S 661.2 文献标志码： A 文章编号： 0513-353X （2014）07-1307-10 Studies on Genetic Diversity of Pear Germplasm Resources in Liaoning Province of China Based on Chloroplast DNA Analysis CHANG Yao-jun1 ，CAO Yu-fen1,* ，ZHANG Jin-mei2 ，TIAN Lu-ming1 ，DONG Xing-guang1 ，ZHANG Ying1 ，QI Dan1，and ZHENG Ying-chun1 Research Institute of Pomology Chinese Academy of Agricultural Sciences Key Laboratory of Biology and Genetic （1 ， ， Improvement of Horticultural Crops Germplasm Resources Utilization Xingcheng Liaoning China National ； ，