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生物学大实验(二)
实验名称:质粒扩增、提取和鉴定实验
实验目的 通过对智力扩增、 提取和鉴定试验的实验原理介绍和实际操作, 加深对分子生
物学基本技术的理解和掌握。
实验仪器设备:电子天平、高压蒸汽灭菌锅、摇床、离心机、不同型号移液枪若干支、
磁力搅拌器、恒温水浴锅、电炉、制冰机、琼脂糖凝胶电泳仪、超净工作台等。
实验原理:质粒主要存在于细菌、放线菌和真菌细胞中,通过对细菌、放线菌和真菌的
培养来实现对质粒的扩增。 经过处理的线状 dna 在外界环境恢复正常的时候不能够复性 而质
粒 dna 可以复性,从而可以实现质粒 dna 和染色体 dna 的分离。限制性内切酶能特意地结合
于一端被称为限制性酶识别系列的 dna 系列之内或其附近的特异位点上,并切割 dna。当对
提取的质粒 dna 进行电泳时,同一质粒 dna 其超螺旋形式的泳动速度要比开环和线状分子的
泳动速度快。
实验步骤:
一 质粒扩增
(1)普通 lb 固体培养基制备:
制备 lb 培养基,倒入灭菌瓶中高压灭菌,待完全冷却后,保存备用。
(2)将大肠杆菌接种于 lb 培养基中, 37℃振荡培养过夜 (200 转/ 分 )
二 质粒 dna 的提取 ( 碱法 )
将菌液倒入 1.5ml 的微量离心管中, 12000rpm 离心一分 30 秒,弃去上清液,以得到较多的细菌沉淀;
、 将微量离心管开口倒置在卫生纸上,使离心管底部的液体流尽。
3 、 加入 100μ l 用冰预冷的溶液 i ,剧烈振荡, 将沉淀彻底悬浮, 然后室温放置 5 分钟。
、 加入 200μ l 现配的溶液 ii ,盖紧管口,轻轻快速颠倒离心管(不要振荡,以避免
dna 断裂),使混合物混匀,冰浴 5~ 10 分钟。
、 加入 150μ l 预冷的溶液 iii ,盖紧管口,温和颠倒混匀,使粘稠地细菌裂解物均匀
地分布于溶液 iii 中,冰浴 5 分钟。
6 、 取上部水相,移入新的离心管,加入 2 倍体积预冷的无水乙醇(也可同时加入 1/10
倍体积的醋酸钠) ,震荡混匀,室温放置 10 分钟沉淀双链 dna,然后 4℃,12000rpm 离心 10min。
7
、 弃去上清液, 将离心管倒置于卫生纸上, 使离心管底部的液体流尽后,
加 入预冷的
1ml 70 %乙醇。
8
、弃去上清液,将离心管倒置于卫生纸上,使液体流尽,置
dna 干燥 5~ 10 分钟。
9
、吸除上清液,将管口倒置于卫生纸上使液体流尽,真空干燥
10 分钟或室温干燥。
10
、 将沉淀溶于 34υ lte
缓冲液或灭菌水( ph8.0 )中,储于 -20 ℃冰箱中
三 dna 酶切反应
1
、 将洁净干燥并经灭菌的
eppendorf 管(最好 0.5ml )编号, 用微量移液枪分别加入
dna(υ l )和相应的限制性内切酶反应
10×缓冲液 2υ l ,将管内溶液混匀后加入
0.5 υ l
酶
液,用手指轻弹管壁使溶液混匀,也可以用微量离心机甩一下,使溶液集中在管底。此步操
作是整个实验成败的关键,要防止错加,漏加。使用限制性内切酶时应尽量减少其离开冰箱
的时间,以免活性降低。
2
、 混匀反应体系后,将
eppendorf 管置于适当的支持物上(如插在泡沫塑料板上)
,
37℃水浴锅保温 2-3 小时,使酶切反应完全。
3
、 每管加入 2υ l0.1mol/l
edta (ph8.0 ),混匀,以停止反应, 置于冰箱之保存备用。
四 dna 的琼脂糖凝胶电泳
1
、 取 5× tbe 缓冲液 100ml 加蒸馏水至 1000ml ,配成
0.5 × tbe 稀释缓冲液,待用。
2
、
胶液的制备:称取
3g 琼脂糖置于 1000ml 锥形瓶中,加入 300ml 0.5 ×tbe 稀释缓
冲液,加入微波炉里加热至琼脂糖全部融化,取出摇匀,此为
1%琼脂糖凝胶液。加热过程中
要不时摇动,使其附于瓶盖上的琼脂糖颗粒进入溶液。加热时应盖上封口膜,以减少水分蒸
发。
3
、
胶版的制备:想冷却至 50-60 ℃的琼脂糖胶液中加入溴化乙锭(
eb)溶液使其终浓
度为 0.5 υ lg/ml 。倒胶时的温度不可太低,否则凝固不均匀,速度也不可太快,否则溶液出
现气泡,待胶完全凝固后,拔出梳子注意不要损伤梳底部的凝胶,然后向槽内加入
0.5 υ ×
tbe
稀释缓冲液至页面恰好没过胶板上表面
4
、
加样:取 20υ l
的酶解液与 2υ l10 ×载样液混匀,用微量移液枪小心加入样品槽
中,每加完一个样品要更换
tip 头以防止互相污染,注意上样时要小心操做,避免损坏凝胶
或将样品槽底部的凝胶刺穿
5
、
电泳:加完样后合上电泳槽盖,立即接
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