环境基因组学研究除草剂2.pptVIP

环境基因组学：研究除草剂 2 ， 4-D 的毒性和抗性机制 报告人：禤淑霞 ? 摘要 ? 前沿 ? 用酵母模型来阐明基因 - 环境的相互作用 ? 用植物模型来阐明基因 - 环境的相互作用 ? 总结与展望 摘要 ? 利用基因组学的信息和工具，能够更好的理解各 种有机体与周围的环境的相互作用。在这里，我 们揭示了环境基因组学这个新的领域如何研究 2,4-D 氯化苯氧乙酸除草剂 (2,4-D 氯化苯氧乙酸 ) 的毒理作用机制和抗性的基本原理。 ? 2,4-D 是最成功和最广泛使用的除草剂之一，但它 的过度使用已经导致杂草抗药性的增加，而且当 使用浓度高于推荐浓度的时候也引发了一些毒物 学的问题。这篇综述以酿酒酵母和拟南芥两种模 式生物来展开关于 2,4-D 的毒性和相应的反应。 前言 ? 2,4-D 的广泛和高强度的使用可能导致一些毒物学的和环境的问题， 而且已经导致出现了抗药性增加的杂草（造成重大的经济损失，威胁 环境和人类健康） ? 利用酿酒酵母和拟南芥两种模式生物，并结合了基因 - 基因的方法， 研究 2 ， 4-D 毒性作用机制和适应反应。在一个细胞或组织的 DNA （基 因型）， RNA （转录组学），蛋白质（蛋白质组学）和代谢物（代谢 组学）水平上，研究所有基因的表达与毒物的响应，这种新的毒性系 统论方法被认为是毒理基因组学。 ? 这种新的各学科间交叉的领域把新的技术和研究病理学和毒物学的较 传统的工具结合起来，进而研究在环境压力下生物的反应。生物学系 统方法论提供了一个空前有力的工具来直接监控毒物学的最早期的反 应 。通过微阵列或表达蛋白质组学，在几乎一出现毒物反应时就能检 测出发生变化的全部基因的表达。而毒性的临床反应可能会几天甚至 几年才表现出来。因此，比起传统的毒物学方法，评估这些基因表达 的改变可能提供一个更早更灵敏的毒性反应的生物标记。 用酵母和植物模型来阐明基因 - 环境 的相互作用 ? 真核模型系统的开发有助于人们了解对环境刺激对人类健 康所产生的影响。由于很多信号途径和它们的分子组成成 分充分保留在模式真核生物中，这些模型系统也成功解释 化学分子在这些基本途径中的表达和功能。大量的模式系 统改进了高质量高通量的基因组工具和增加了数据库。 ? 酿酒酵母是单细胞的真核模型，具有非致病性，便宜，容 易进行遗传操作，好的特性以及快速生长率等特点 。借 助于简单可用的数据库和几年的后基因组研究也收集了大 量的生物学信息 ? 拟南芥的小型，快速生活周期和多种子产量使得人们关注 并研究了它的强烈的遗传性，生化和生理超过 40 年，从而 为实验室操作和培养提供了有利条件 。大量的基因组资 源使得拟南芥可以对植物在非生命的压力时的反应进行系 统选择的分子和系统广泛的研究 酵母对 2 ， 4-D 的全面反应，评估 2 ， 4-D 的毒性 ? 通过多药物抵抗和细胞外被膜重排来解毒 ? 细胞内酸化和 pH 恢复 ? 强氧化剂反应和抗氧化性反应 ? 一般胁迫应激反应 ? 营养限制的感应和反应： TOR 途径的作用 拟南芥对 2,4-D 应激反应 除草剂 2,4- D 作用的模型 ? 分子机制研究 ? 通过多药耐药运输来解毒 ? 细胞内 pH 恢复和膜或细胞壁改变 ? 普通压力应激 ? TOR 途径 ? 图 3 ，酵母对 2,4-D 适应性反应的模式。 (a) 刺激反应的 H+-ATPases 出现在质膜和液泡膜 中。 (b) 抗氧化防卫活化。 (c) 基因转录活化编码多药物运输，推定涉及除草剂抗衡离子 的主动运输，细胞壁和质膜重排。 (d) 通过 TOR 途径进行选择性营养新陈代谢的活化作用 ? 在低 pH 环境中，高亲脂弱酸性的 2 ， 4-D 呈 现未解离的亲脂毒性状态（ RCOOH ），因 此经由被动扩散能容易地通过质膜。在中 性的细胞溶质中， 2 ， 4-D 的非解离形式分 解，导致细胞内酸化和毒性抗衡离子的堆 积（ RCOO? ），而不能轻易的通过质膜脂 质双分子层。因此，低的 pH 值（例如酸性 土壤，动物消化道）会显著的引起除草剂 的毒性。 ? 在酵母中，多重抗药性质膜转运属于扩散载体超家族 (MFS) 或 ATP 结合盒 (ABC) 超家族，给予药物和其他化学 应力组成的抗性，可能是促进了它们的非亲脂性状态的转 变。在 MDR 家族中 Tpo1p 和 Pdr5p （分别属于 MFS 和 ABC 超家族）的参与酵母对 2 ， 4-D 的抗性的基础上，假设这些 质膜运输促进了 2,4-D 抗衡离子的主动运输。对 2,4-D 起