硬蜱科四种蜱核糖体全基因组分析.pdfVIP

目 录 目 录 摘 要I Abstract III 1 文献综述 1 1.1 东北地区重要的硬蜱 1 1.1.1 森林革蜱 1 1.1.2 日本血蜱2 1.1.3 全沟硬蜱2 1.1.4 长角血蜱 3 1.2 蜱核糖体全基因组研究进展 3 1.2.1 蜱核糖体18S 研究进展4 1.2.2 蜱核糖体ITS1 研究进展 5 1.2.3 蜱核糖体5.8S 研究进展 7 1.2.4 蜱核糖体ITS2 研究进展 10 1.2.5 蜱核糖体28S 研究进展 13 1.2.6 蜱核糖体IGS 研究进展 14 1.3 目的和意义 14 2 材料方法 15 2.1 材料 15 2.1.1 蜱虫样品 15 2.1.2 引物设计 15 2.1.3 主要试剂、仪器及应用软件 16 2.2 方法 16 2.2.1 采集蜱的方法 16 2.2.2 蜱的形态学鉴定 16 2.2.3 总DNA 的提取 16 2.2.4 各蜱核糖体基因扩增 17 i 硬蜱科四种蜱核糖体全基因组分析 2.2.5 序列分析 18 2.2.6 同源性分析 18 2.2.7 序列分析 18 3 结果 21 3.1 蜱的形态学鉴定结果 21 3.2 核糖体各部分PCR 扩增结果 23 3.2.1 18S PCR 扩增结果 23 3.2.2 ITS1 PCR 扩增结果 24 3.2.3 ITS2 PCR 扩增结果 25 3.2.4 28S-1 PCR 扩增结果 26 3.2.5 28S-2 PCR 扩增结果 27 3.2.6 28S-3 PCR 扩增结果 28 3.2.7 IGS PCR 扩增结果 29 3.3 四种蜱核糖体全基因组分析 29 3.3.1 硬蜱科四种蜱核糖体长度分析 30 3.3.2 硬蜱科四种蜱核糖体A+T 含量分析 31 3.3.3 硬蜱科四种蜱核糖体碱基突变和缺失 32 3.3.4 硬蜱科四种蜱核糖体种内差异分析 36 3.3.5 硬蜱科四种蜱核糖体种间差异分析 36 3.3.6 硬蜱科四种蜱核糖体IGS 的侧翼与重复序列分析 37 3.4 同源性分析 39 3.4.1 硬蜱科四种蜱核糖体18S 同源性分析 39 3.4.2 硬蜱科四种蜱核糖体ITS1 同源性分析 39 3.4.3 硬蜱科四种蜱核糖体5.8S 同源性分析 39 3.4.4 硬蜱科四种蜱核糖体ITS2 同源性分析 40 3.4.5 硬蜱科四种蜱核糖体28S 同源性分析 40 3.4.6 硬蜱科四种蜱核糖体IGS 同源性分析 40 3.4.7 硬蜱科四种蜱核糖体全基因组同源性分析 41 ii 目 录 3.5 进化分析49 4 讨论 55