菊花矮化类病毒的分子检测与序列分析.pdfVIP

园 艺 学 报 2011 ，38 （12）：2349 –2356 http ：// www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail ：yuanyixuebao@126.com 菊花矮化类病毒的分子检测与序列分析 张志想 1 ，葛蓓孛 1,2，潘 嵩 1，赵 哲 1,2，王红清 2 ，李世访 1,* 1 2 （ 中国农业科学院植物保护研究所，植物病虫害生物学国家重点实验室，北京 100193； 中国农业大学农学与生物 技术学院果树系，北京 100193 ） 摘 要： 菊花矮化病由菊花矮化类病毒（ Chrysanthemum stunt viroid ，CSVd ）引起。从北京、海南万 宁、合肥和哈尔滨共采集了 122 个野生及商业种植的菊花样品， 使用改进的 CTAB 法提取菊花总 RNA 后， 通过斑点杂交检测 CSVd ，应用 RT-PCR 对阳性样品进行克隆、测序。斑点杂交结果表明，在检测的 122 个样品中有 14 个样品感染了 CSVd ，感染率为 11.5%；除哈尔滨外的其余 3 个地区均有 CSVd 的发生。 序 列比较分析结果表明， 中国的 CSVd 分离物与韩国和日本分离物的序列最为接近， 对其二级结构进行分析 发现，与 CSVd 的参考序列（ NC002015 ）相比，所获得的中国 CSVd 分离物的序列中虽然有 21 个碱基发 生了突变（大多位于二级结构上的致病区内） ，但并未影响其折叠成稳定的拟棒状结构。 关键词： 菊花；菊花矮化类病毒；斑点杂交； RT-PCR；序列分析 中图分类号： S 682.1+ 1 文献标识码： A 文章编号： 0513-353X （2011 ）12-2349-08 Molecular Detection and Sequences Analysis of Chrysanthemum stunt viroid 1 1,2 1 1,2 2 1,* ZHANG Zhi-xiang ，GE Bei-bei ，PAN Song ，ZHAO Zhe ，WANG Hong-qing ，and LI Shi-fang 1 （State Key Laboratory of Biology of Plant Diseases and Insect Pests ， Institute of Plant Protection ，Chinese Academy of 2 Agricultural Sciences ，Beijing 100193，China ； Department of Fruit Science