菊花矮化类病毒的分子检测与序列分析.pdfVIP

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  • 2020-08-19 发布于湖北
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菊花矮化类病毒的分子检测与序列分析.pdf

园 艺 学 报 2011 ,38 (12):2349 –2356 http :// www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail :yuanyixuebao@126.com 菊花矮化类病毒的分子检测与序列分析 张志想 1 ,葛蓓孛 1,2,潘 嵩 1,赵 哲 1,2,王红清 2 ,李世访 1,* 1 2 ( 中国农业科学院植物保护研究所,植物病虫害生物学国家重点实验室,北京 100193; 中国农业大学农学与生物 技术学院果树系,北京 100193 ) 摘 要: 菊花矮化病由菊花矮化类病毒( Chrysanthemum stunt viroid ,CSVd )引起。从北京、海南万 宁、合肥和哈尔滨共采集了 122 个野生及商业种植的菊花样品, 使用改进的 CTAB 法提取菊花总 RNA 后, 通过斑点杂交检测 CSVd ,应用 RT-PCR 对阳性样品进行克隆、测序。斑点杂交结果表明,在检测的 122 个样品中有 14 个样品感染了 CSVd ,感染率为 11.5%;除哈尔滨外的其余 3 个地区均有 CSVd 的发生。 序 列比较分析结果表明, 中国的 CSVd 分离物与韩国和日本分离物的序列最为接近, 对其二级结构进行分析 发现,与 CSVd 的参考序列( NC002015 )相比,所获得的中国 CSVd 分离物的序列中虽然有 21 个碱基发 生了突变(大多位于二级结构上的致病区内) ,但并未影响其折叠成稳定的拟棒状结构。 关键词: 菊花;菊花矮化类病毒;斑点杂交; RT-PCR;序列分析 中图分类号: S 682.1+ 1 文献标识码: A 文章编号: 0513-353X (2011 )12-2349-08 Molecular Detection and Sequences Analysis of Chrysanthemum stunt viroid 1 1,2 1 1,2 2 1,* ZHANG Zhi-xiang ,GE Bei-bei ,PAN Song ,ZHAO Zhe ,WANG Hong-qing ,and LI Shi-fang 1 (State Key Laboratory of Biology of Plant Diseases and Insect Pests , Institute of Plant Protection ,Chinese Academy of 2 Agricultural Sciences ,Beijing 100193,China ; Department of Fruit Science

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