生物信息数据库文库.pptx

;授课大纲;;重要生物信息中心 重要生物信息数据库 数据库检索工具 生物分析相关软件;一、重要生物信息中心 Bioinformatics Centres;;NCBI：;;;;;;/chinese/;/;;;;生物信息学数据的表示形式;生物信息学数据的表示形式;信息表示：关系数据库;生物信息学数据存在的问题;数据集成;生物信息学最重要的任务是从海量数据中提取新知识;生物数据库的种类;序列数据库 核酸序列数据库 (EMBL、GenBank、DDBJ) 常用蛋白质序列数据库(Swissprot,PIR) 结构数据库 蛋白质结构数据库(PDB) 蛋白质分类数据库(SCOP、CATH ) 其它数据库 ;序列数据库; 美国的核酸数据库GenBank〖Banson,D.A. et al. (1998) Nucleic Acids Res. 26, 1-7〗从1979年开始建设，1982年正式运行； 欧洲分子生物学实验室的EMBL数据库也于1982年开始服务 日本于1984年开始建立国家级的核酸数据库DDBJ，并于1987年正式服务。 　　从那个时候以来，DNA序列的数据已经从80年代初期的百把条序列，几十万碱基上升至现在的110亿碱基！这就是说，在短短的约18年间，数据量增长了近十万倍。;核酸序列;蛋白质序列数据库;蛋白质序列;蛋白质数据库种类和特点;生物大分子三维结构数据库;蛋白质结