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二代测序技术的应用及分析流程
袁力赟
2015-8-26
1 二代测序技术基本介绍
目
2 二代测序技术的应用及基本流程
录
3 不同测序水平数据的整合分析
1 二代测序技术基本介绍
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2 二代测序技术的应用及基本流程
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3 不同测序水平数据的整合分析
二代测序vs 一代测序
Nat Biotech 26:1135(2008)
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几种主流平台的关键参数对比
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两类建库技术/测序模式
• 单个Reads
• Pair End/Meta Pair
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Pair-end 建库和测序
Known Distance
Read 1 Read 2
Repetitive DNA Paired read maps uniquely
Single read maps to multiple positions
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Mate-pair 建库和测序
Known Distance
Read 1 Read 2
Molecular Ecology Resources (2011)
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一些测序中提到的基本概念
• Yield, data size produced by sequencer.
• Reads, sequenced fragments.
• Read length and quality.
•
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