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目录
TOC \o 1-3 \h \z \u 生产部克隆组操作流程 1
一、PCR扩增目的片段 1
二、PCR产物的纯化(或者切胶纯化) 4
三、DNA片段的酶切及纯化 6
四、质粒的提取及酶切 7
五、连接反应 9
六、感受态细胞的制备 10
六、转化 12
七、挑取单克隆 13
八、菌液PCR验证 14
九、测序 16
十、转交 16
附:克隆组常用试剂配方 17
生产部克隆组操作流程
一、PCR扩增目的片段
实验原理:PCR(polymerase chain reaction)是一种常用的分子生物学技术,常用于体外扩增特异的DNA片段。基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至94℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链(有时直接用单链DNA作为模板),以便它与引物结合;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在DNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链,重复循环变性--退火--延伸三个基本过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩增目的基因扩增放大几百万倍。
1、实验仪器及试剂
1.1实验仪器:PCR仪: LongGene L96+ Thermal cycler
离心机:TGL-16, 湘仪
凝胶电泳仪:Tanon EPS 300
凝胶成像系统:Tanon 2500,
其林贝尔离心机:LX-5000
微波炉
1.2实验试剂:天根pfu DNA polymerase(2.5U/ul)
天根dNTP(10mM/ul)
TAKARA DNA marker(DL5000、DL10000)
1XTBE缓冲液
超纯水
2、实验步骤:
(1)将干粉引物以12000rpm离心30s,小心打开管盖按照引物订单报告加灭菌的超纯水稀释至10mM,震荡混匀(打开盖子前一定要离心,避免干粉引物飞溅)。
(2)在0.2ml的离心管中加入以下成分:
质粒模版(25ng/ul)
1ul
Primer1(10mM)
1ul
Primer2(10mM)
1ul
10×Pfu Buffer
5ul
dNTP mixture(10mM)
1ul
Pfu DNA 酶(2.5u/ul)
0.5ul
ddH2O
?ul
总体积
50ul
(模板一般可以是质粒、单或双链DNA片段、cDNA等或其他不同复杂类型的模版,加入的量有一定的变化。一个典型的50ulPCR反应,加入的模板量为0.1ug-2ug;dNTP的浓度为50umol/L-200umol/L;每条引物的量为0.1umol-1umol,加入的酶为1.5U-2.5U。最后加水保证总体积为50ul,做多管的时候可以把除引物模板以外的组分混合后分装,离心5s混匀,然后置于PCR仪的工作台上)。
(3)设置PCR运行参数并运行:
(4)用微波炉加热0.75%琼脂糖凝胶至完全溶解,在胶板上插上梳子倒一块胶,静置凝固。
(5)PCR反应结束后取2ul产物进行电泳,检验是否扩增成功,确定有目的条带后其余样品进行PCR产物纯化(或胶回收)。
二、PCR产物的纯化(或者切胶纯化)
实验原理:PCR产物一般都含有过量的引物、DNA聚合酶、引物二聚体、模板DNA及dNTP等,这些成分的存在将直接影响到后续的酶切反应、双脱氧PCR测序反应等过程,因此有必要除去。目前核酸纯化的方法有很多,商用化试剂盒的出现使得DNA的纯化过程变得更加简便快捷。本实验采用Biospin胶回收试剂盒对PCR产物直接进行纯化,Extraction Buffer促进60bp-23kb间的DNA片段选择性的吸附在膜上,经Wash Buffer洗涤除去引物二聚体、酶蛋白、单核苷酸、荧光染料等,最后经去离子水将目的DNA片段从膜上洗脱下来。
1、实验仪器及试剂
1.1实验仪器:湖南湘仪离心机:TGL-16,
金属恒温加热器:博彩生物 HB301
1.2实验试剂:Biospin胶回收试剂盒
超纯水
2、直接纯化实验步骤:
(1)向PCR产物中加入5倍体积的Extrac
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