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实验一 植物DNA的提取与纯化
一、 实验目的:
掌握植物DNA的提取与纯化的原理和一般步骤。
二、 实验原理:
植物DNA的分离是分子生物学、遗传学和育种学等植物科学研究的基础要求。对
DNA提取一般有三个要求:1. DNA的纯度可以满足下游操作的要求; 2. DNA必须完整;
DNA应当有足够的量。
一般来说,构建基因组文库,初始DNA长度必须在100kb以上,否则酶切后两边都带 合适末端的有效片段很少。而进行 RFLP和PCR分析,DNA长度可短至50kb,在该长度
以上,可保证酶切后产生 RFLP片段(20kb以下),并可保证包含 PCR所扩增的片段(— 般2kb以下)。
天然状态的DNA是以脱氧核糖核蛋白(DNP)形式存在于细胞核中。要从细胞中提取 DNA时,先把DNP抽提出来,再把蛋白质和糖去除,同时除去 RNA及无机离子等,从 中分离DNA。
提取植物DNA的方法主要采用 SDS和CTAB法,对它们进行稍加修改就可以应用于 DNA的微量提取。两种方法均采用去污剂裂解细胞并保护 DNA不受内源核酸内切酶降
解。本实验采用SDS法提取DNA°SDS是有效的阴离子去垢剂,细胞中DNA与蛋白质之 间常借静电引力或配位键结合 ,SDS能够破坏这种价键。具体方法简单说来就是利用液 氮对植物组织进行研磨,从而破碎细胞。细胞提取液中含有的 SDS溶解膜蛋白而破坏细 胞膜,使蛋白质变性而沉淀下来。 EDTA抑制DNA酶的活性。再用酚、氯仿抽提的方法
去除蛋白,得到的 DNA溶液经乙醇沉淀。
三、 实验材料和试剂:
1?实验材料:新鲜植物组织(小麦嫩叶) 。
2?器材:研钵和研棒、水浴锅、离心机、移液器及枪头、离心管。
3?药品试剂:提取液、无水乙醇、 70%乙醇、TE缓冲液、氯仿戊醇(24:1 )。
四、 实验步骤:
1?取新鲜叶片约3g,剪碎,加入液氮充分研磨后转移至 2ml离心管中;
在 65C预热的提取液中按 L加入Na Bisufite , 充分混匀;
3?在管中加入适量提取液, 60 C水浴保温约30min,不时颠倒混匀;
4?冷却至室温后加入等体积氯仿 /异戊醇,用力摇匀后,放置摇床上摇动 15min左右;
5?室温下10000rpm离心15min ,小心吸上清于新的离心管中,加入两倍体积的冷酒精,
-20 C放置 1h;
6?挑出DNA置于新的管中。加入适量 70%酒精,摇动洗涤10min,重复洗涤2-3次;
7?吹干DNA,加入适量TE在65C溶解,4C或-20C贮存。
五、 实验结果:
如下图所示,所提 DNA的琼脂糖凝胶电泳结果如示:
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其中第八泳道(从右至左,箭头所指)为我们所提 DNA的电泳结果。可以看出有两条
比较亮的带,其中靠近点样孔的条带为 DNA带,远离点样孔的条带为 RNA带。由于此次实
验没有对RNA消化,所以泳道有 RNA条带。
六、注意事项:
尽量取材幼嫩组织,最好在早晨取材,可以避免过多的糖分污染;
2?提取液不能加入过多,否则影响后续反应的进行;
3?加入提取液后应多次颠倒混匀,以确保反应充分进行,颠倒不能过于剧烈,剧烈颠倒 会导致DNA分子的断裂;
4?加入氯仿:戊醇后要剧烈摇晃,确保杂质去除彻底;
5?微量移液枪的使用一定要规范,吸取氯仿等有机试剂要注意不要将试剂吸入枪中。
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实验二PCR和分子标记技术及其应用
一、 实验目的:
掌握PCR的基本操作及分子标记技术的应用。
二、 实验原理:
PCR原理:类似于DNA的体内复制。首先待扩增 DNA?模板加热变性解链,随之将 反应混合物冷却至某一温度,这一温度可使引物与它的靶序列发生退火,再将温度升高 使退火引物在 DNA聚合酶作用下得以延伸。?这种热变性-复性-延伸的过程就是一个 PCR 循环,PCR就是在合适条件下的这种循环的不断重复。
DNA分子水平上的多态性检测技术是进行基因组研究的基础。分子标记具有数量 丰富、信息量大、与生长发育无关,取材不受限制;较多共显性,信息量完整在真核生 物中,基因组DNA多态性要远远多于各种基因的遗传多态性,因为基因组中存在着大 量的不编码的 DNA序列,它们的变异不受或较少地受自然选择的制约。可以用于种质 资源研究、品质纯度鉴定、构建遗传连锁图、基因定位( QTL)、标记辅助选择、比较
基因组研究、基因克隆(图位克隆)、生物起源进化的研究。
(1) RFLP物种的基因组 DNA在限制性内切酶作用下,产生相当多的大小不等的
片段,用放射性同位素标记的 DNA作探针,把与
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