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PopGene 使用说明 翻译by :一路忘了哭
用户快速指导
POPGENE 版本1.32
物种遗传分析--基于微软windows 的免费软件
翻译by :一路忘了哭
2008 年10 月24 日 星期五
1
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PopGene 使用说明 翻译by :一路忘了哭
一、POPGENE 窗口概览
该软件由C++语言书写。
POPGENE 窗口计算环境有两种类型:Data display windows (数据显示窗
口)和 Dialog boxes (对话框).
其窗口菜单包含八部分:
File :用于建立新的数据文件或打开存在的文件
Edit :用于从其他窗口修改和复制文本
Search:寻找或取代选择的文本
Co-Dominant:用于通过用co-dominant 标志去调用物种遗传分析
Dominant :用于通过用dominant 标志去调用物种遗传分析
Quantitative:用于通过用量化特征去调用物种遗传分析
Window :用于布置、选择和控制窗口分布
Help :帮助,告诉你如何使用该软件
在菜单栏下面有工具栏,可以快速容易的使用窗口的特色部分。
底部有状态栏,它提供的信息包括光标位置和输入数据大小。
二、POPGENE 计算程序窗口概览
POPGENE/Co-Dominant 和Dominant markers 两个对话框:Haploid Data
Analysis 和 Diploid Data Analysis 。 每个对话框里有3 个等级的Hierarchical
Structure:Single Populations, Groups 和Multiple populations 。 Single Locus
和 Multilocus 遗传参数的评定通过选择一个或多个Hierarchical Structure 核对
框实现的。
HAPLOID DATA ANALYSIS
Gene Frequency: 从原始数据中判断每个locus 的基因频率
Allele Number:计数非零频率等位基因的数量
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PopGene 使用说明 翻译by :一路忘了哭
Effective Allele Number:评价彼此的结合性
Polymorphic Loci: 不管等位基因频率,所有多种组合形态位置的百分比
Gene Diversity:判断Nei’s (1973)基因多样性
Shannon Index: 判断Shannon 信息指数,以此作为基因多样性的程度
2 (G2)测试
Homogeneity Test: 构
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