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- 2020-10-10 发布于山东
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GenBank 中字符的意思
Nucleotide 数据库分为三个子数据库:
EST 表:达序列标记数据库
GSS 基:因组测序序列数据库
CoreNucleotide : 包含所有未被以上两个子数据库收录的核苷酸序列
MeSH: 查询缩写基因的全称
3、 RefSeq(Reference Sequence)序列接受号 :
1) mRNA 记录( NM_* ) :
e.g.:NM_000492
(2)基因组的 DNA 重叠群( NT_* ) :
e.g.:NT_000347
(3)完整的基因组或染色体( NC_*) :
e.g.:NC_000907
(4)基因组的局部区域( NG_*) :
e.g.:NG_000019
(5)从人类基因组注释、加工得到的序列模型( XM, XP, or XR_* ):
e.g.:XM_000483
● GenBank 记录中特性表中的主要关键词
:
关键词
解 释
关键词
解 释
misc_feature
生物学特性无法用特性
promoter
转录起始区
表关键词描述的序列
misc_difference
序列特性无法用特性表
CAAT_signal
真核启动子上游的 CAAT
关键词描述的序列
盒 ,与 RNA 结合相关
conflict
同一序列在不同的研究
TATA_signal
真核启动子的
TATA盒
中在位
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