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来源不同:siRNA来源于转基因或病毒RNA,由长dsRNA转变而来;miRNA来源于内源转录本,是细胞内RNA的固有组分之一,由具有发夹状结构的pre-miRNA转变而来; 结构不同:siRNA主要以双链形式存在,其3’端存在2个非配对的碱基,通常为UU;miRNA主要以单链形式存在; 对靶RNA 的特异性不同: siRNA与靶mRNA完全互补配对结合;miRNA与靶RNA并不完全互补,存在错配现象。靶序列有一个核苷酸突变,就会影响到siRNA的作用功能,但不会影响到miRNA的功能; 作用形式不同:siRNA主要在转录后通过降解mRNA发挥作用,而miRNA只在蛋白质翻译水平上负调控靶基因的表达。 不同点: (四)、RNA干扰的研究方法 一般技术路线 (五)、RNA干扰的应用 1.基因功能研究 由于RNAi具有高度的序列专一性和有效的干扰活力,可以特异地使特定基因沉默,获得功能丧失或降低突变,因此可以作为功能基因组学的一种强有力的研究工具。 已有研究表明RNAi能够在哺乳动物中抑制特定基因的表达,制作多种表型,而且抑制基因表达的时间可以控制在发育的任何阶段,产生类似基因敲除的效应。 与传统的基因敲除技术相比,这一技术具有投入少,周期短,操作简单等优势,近来RNAi成功用于构建转基因动物模型的报道日益增多,标志着RNAi将成为研究基因功能不可或缺的工具。 2.病毒性疾病的治疗 使用RNAi技术来阻止艾滋病病毒进入人体细胞。某研究小组设计合成的lenti病毒载体引入siRNA,激发RNAi使其抑制了HIV-1的coreceptor-CCR5(化介素受体, HIV-1的辅因子)进入人体外周T淋巴细胞,而不影响另一种HIV-1主要的coreceptor-CCR4,从而使以lenti病毒载体为媒介引导siRNA进入细胞内产生了免疫应答,由此治疗HIV-1和其他病毒感染性疾病的可行性大大增加。 ——艾滋病 2.病毒性疾病的治疗 Shlomai和Shaul设计了各针对HBV基因19nt的两种pSUPER载体:pSUPER X-siRNA和pSUPER core-siRNA。已转染含1.3 X wt HBV基因质粒载体的Huh7细胞再被 X-siRNA或 core-siRNA转染后,core蛋白水平分别降低了89%、63%,转染X-siRNA的细胞中HBsAg降低60%,但转染core-siRNA对HBsAg表达无明显影响(X-siRNA干扰沉默了所有的病毒转录物,而core-siRNA仅沉默3.5kb、3.9kb的mRNA)。 —— HBV(乙肝病毒) 2.病毒性疾病的治疗 Randall等证明了针对HCV RNA的siRNA转染细胞4天后可使细胞质中复制的HCV RNA降低80倍;将siRNA 转染至已有HCV感染、复制的细胞,siRNA对98%以上可检测到HCV抗原、HCV复制活跃的细胞有抑制作用;siRNA干扰沉默HCV RNA具有剂量依赖性和序列特异性。Kapadia等 也证明了siRNA特异抑制HCV RNA复制、阻止相关蛋白表达的作用。 —— HCV(丙肝病毒) 2.病毒性疾病的治疗 RNAi还可应用于其它病毒感染如脊髓灰质炎病毒等,siRNA已证实介导人类细胞的细胞间抗病毒免疫,用siRNA对Magi细胞进行预处理可使其对病毒的抵抗能力增强。 严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome,SARS)的防治研究,RNAi也受到了重视。siRNA在感染的早期阶段能有效地抑制病毒的复制,病毒感染能被针对病毒基因和相关宿主基因的siRNA所阻断,这些结果提示RNAi能胜任许多病毒的治疗。 ——脊髓灰质炎病毒/SARS 3.肿瘤治疗 用RNAi特异性地抑制癌基因、癌相关基因或突变基因的过度表达,使这类基因保持在静默或休眠状态,从而有望用这种新的手段治疗各种恶性肿瘤。 (1)RNAi可应用于敲除点突变激活的癌基因。 (2)RNAi可应用于抑制插入基因及融合基因的表达。 (3)RNAi可应用于抑制基因扩增。 Li等在3个肝癌细胞系Hep3B、HepG2、SNU449中对cyclin E的研究中发现,转染siRNA组48 h后生长抑制均达到90%,而对照组无作用,3天后凋亡率分别为16% 、44%和3l%,而对照组仅为l%。 3.肿瘤治疗 Survivin基因是迄今为止克隆出的最小凋亡抑制蛋白家族成员,可通过抑制caspase级链反应下游的caspase3,caspase7发挥其抗凋亡作用。现在研究已证实survivin基因参与了肝癌的发生与发展,并且还与化疗的耐药性相关。降低survivin基因在肝癌细胞中的表达不仅可诱导肝癌细胞的凋亡、抑制肝癌细胞的生长,还可增强其对化疗的
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