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运用 NCBI 数据库查找目的蛋白序列或目的碱基序列
第 1 种方法
1.打开 NCBI 官网,并选择 Gene 菜单,如下图。
2.在搜索栏内输入想要查找的蛋白名称或基因名称,此处以基因 RSK2 为例,如图。
3.在搜索结果中查找目的蛋白, 注意 Description 栏会标明物种信息, 以 human 为例,Aliases
栏会列出目的蛋白的各种别名。
4.在 Searchresult 页面中点击你要找的蛋白名称 (Name/Gene ID ),进入页面并在页面找到 “”
“NCBI Reference Sequences (RefSeq) ”条目,并在其子条目中找到“ mRNA and Protein(s)
”,查找 mRNA 碱基序列点击 NM ,查找蛋白氨基酸序列点击 NP ,以下以查找 mRNA 碱基
序 列 为 例 如 下 :
点击 NM-004586.2 进入页面后如下:
在页面下方会列出 mRNA 的序列:
第 2 中方法
1.进入 Uniplot 数据库,在搜索栏中直接输入要查找的基因或蛋白名称,如下图:
2.进入以下页面:
3.在搜索结果 Entry name 栏中会列出不同物种选项,且会有 Protein names 及 Gene
names , 点击所要选择物种蛋白,进入以下页面。
4. 点击页面页面左侧的 Sequence栏,并找到 Sequence databases ,其下面表格
中有 RefSeqi ,其中包含 NP及 NM。
5. 此处以查找 mRNA为例,点击 NM,页面会跳转至 NCBI的查找页面,如下:
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