生物化学章节总结5.docVIP

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2020-11-03 发布于安徽
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生物化学章节总结5.doc

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实例溶菌酶胰核糖核苷酸酶A 羧肽酶丝氨酸蛋白酶作用水解多糖连，溶解细菌细胞壁。NAM的C1和NAG的C4之间的糖苷键专一性水解RNA的磷酸二酯键作为外肽酶，催化肽链C端的肽键水解。对羧基末端芳香族或大的脂肪族侧链较为敏感。消化作用，破坏肽键。酶活性基团 Glu35和Asp52 His12和His119和Lys41 Zn+和Arg127和Glu270和Tyr248和Arg145 His57和Asp102和Ser195组成的催化三联体。中间复合物（过渡态）碳正离子五价磷 Zn+活性水四面体肽键机理 Glu与Asp的协同作用表现为酸碱催化。 His12和His119是通过广义酸碱催化作用的。羧肽酶与底物结合，引起底物构象的变化，是诱导契合的典型例证。典型的酸碱催化和共价催化的例子。过程 1.底物进入活性中心，由于空间效应和Asp的作用，D残基由椅形变为半椅形。 2.Glu的羧基提供一个H+，是1-4糖苷键断裂。形成正碳离子过渡态。3.D残基的正碳离子过渡态与溶剂中的-OH结合，打开缺口。 1.His12作为碱，与核糖C2-OH的质子结合，促进C2O与磷酸的环化。His119作为酸，提供质子，生成C5-CH2OH. 2.His12作为酸，His119作为碱，使磷酸水解断开。 3.Lys41正电荷对磷酸环化和开环过程中过渡态的物磷酸的瞬时形成有关。 1.活化水分子的亲核氧原子攻击底物羰基碳原子。Glu270作为广义碱，从Zn+结合的水中夺取一个质子，形成带负电的四面体过渡态中间物。通过锌离子和Arg127带正电荷的侧脸的静电相互作用得以稳定。 2.Glu270的-COOH作为广义酸，为肽的-NH基提供一个质子，肽键断裂。 1.水解反应的酰化阶段。Ser的-OH攻击酰胺键，敏感键断裂胺氮键获得His57的咪唑氢，羧化部分连到Ser-OH上。C-N键断裂。胺端释放。 2.His吸引水，攻击Ser的羧化部分，酯键断裂。释放底物，酶恢复自由状态。第十章、酶催化反应的实例