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蛋白质工程
一、名词解释:
1.蛋白质工程:是研究蛋白质结构和定点改造蛋白质结构一门学科。它利用基因工程手段,经过有控制基因修饰和基因合成,对现有蛋白质进行定向改造,以期取得性能愈加优良、更符合人类社会需要蛋白质分子。
2. 抗体:指机体免疫系统在抗原刺激下产生可和对应抗原发生特异性结合免疫球蛋白。
3. 人-鼠嵌合抗体:用鼠可变区和人恒定区融合形成抗体。
4.人源化抗体:将鼠杂交瘤抗体超变区嫁接到人抗体上形成抗体。
5. 一级结构:是多肽链中氨基酸残基从N-末端到C-末端排列次序及二硫键位置。
6.二级结构:是指多肽链主链借助氢键排列成特有规则反复构象。
7.超二级结构(结构模体):一级次序上相邻二级结构在三维折叠中,相互靠近、按特定几何排布形成排列规则、在空间结构上能够识别、能够同一结构模式出现在不一样蛋白质中二级结构组合体,称为结构模体。
8.发夹式β模体(或ββ组合单位):两段相邻反平行β链被一环链连接在一起组成组合单位,其形貌和发夹相同,称为发夹式β模体。
9.希腊钥匙模体:四段紧邻反平行β链以特定方法往返往复组合,其形貌类似于古希腊钥匙上特有回形装饰纹,故称为希腊钥匙型模体。
10.β-α-β模体:是序列上连续、相邻两股平行β链和一段α螺旋连接而形成组合。
11.结构域:二级结构和结构模体以特定方法组织连接,在蛋白质分子中形成两个或多个在空间上能够显著区分三级折叠实体,称为结构域。
12.三级结构:在二级结构、结构模体基础上,深入盘曲、折叠形成,包含主链、侧链在内全部原子和基团空间排布。
13.四级结构:是指在多条肽链组成一个蛋白质分子中,各亚单位在寡聚蛋白质中空间排布及亚单位间相互作用。
14.优势构象:任何氨基酸侧链中组成基团全部能够绕着其间C-C单键旋转,从而产生多种不一样构象。AA分子多种构象异构体并不是平均分布, 总是以其最稳定构象为关键存在形式即为优势构象。
15.交错构象:是能量上最有利排布,在这种构象中,一个碳原子替换基恰好处于另一个碳原子两个替换基之间。
16.旋转异构体:大多数氨基酸残基侧链全部有一个或少数多个交错构象作为优势构象最常常出现在天然蛋白质中,称旋转异构体。
17.肽键:由一个氨基酸α-COOH 和另一个氨基酸α-NH2脱水缩合形成共价键(或酰胺键)。肽键含有局部双键性质,其键长比通常C-N单键短,所以肽键不能旋转。肽键有反式(trans)和顺式(cis)两种构型。
18.肽:经过肽键将氨基酸连接在一起而形成链状化合物。
19.构型:是一个分子中原子特定空间排布。当一个构型改变为另一个构型时必需有共价键断裂和重新形成。
20.构象:是组成份子原子或基团绕单键旋转而形成不一样空间排布。
21.肽单位:因为肽键含有部分双键性质,肽键连接基团处于同一平面,含有确定键长和键角,是多肽链中刚性结构,称为肽单位(或肽平面)。
22.多肽主链:有序连接肽单位就是多肽链主链。
23.扭角:由4个原子(或基团)组成系统投影在和B-C键正交平面上,A-B键投影和C-D键投影之间夹角称为扭角。(这个角度也可视为A-B-C决定平面和B-C-D决定平面间夹角,故也称为双面角)
24.拉氏构象图:Ramachandran依据蛋白质中 非键合原子间最小接触距离,确定了哪些成对二面角(φ,ψ)所要求两个相邻肽单位构象是许可,哪些是不许可,而且以φ为横坐标,以ψ为纵坐标,在坐标图上标出,该坐标图称拉氏构象图。
25.偶极子:大小相等符号相反两个电荷组成体系。
26.偶极矩(μ):正、负电荷中心间距离(r)和电荷中心所带电量(q)乘积。μ=r×q。它是一个矢量,方向要求为从正电中心指向负电中心。
27.疏水内核:是指蛋白质分子内部疏水侧链紧密堆积而组成疏水区域。
28.疏水作用:是指蛋白质疏水基团相互靠近、聚集,以避开水现象。
29.β层: 两条或多条伸展β链侧向聚集,经过相邻肽链主链上N-H和C=O之间有规则氢键连接形成锯齿状片层结构。
30.混合型β层: 即一部分以平行方法排布,而另一部分以反平行方法排布。
31.环肽链:在蛋白质三维结构中,连接相对刚性α螺旋和β层组合环状肽链,称环肽链(loop)。环肽链常含有相当不一样长度和形貌(即构象灵恬性),并含有较大构象柔性。是蛋白质结构另一类基础组件。回折结构基础特征是使其所连接肽链发生180°急转弯。
32.β转折:是由4个氨基酸残基[i~(i+3)]次序连接,使肽链弯折180°特殊构象。
33.γ转折:由三个氨基酸残基组成,使肽链弯折180°构象。
34.β发夹:经过一段短环链将两条相邻β链连接在一起结构,称为β发夹或发夹结构。
35.β-α-β模体:是序列上连续、相邻两股平行β链和一段α螺旋连接而形成组合。
蛋白质折叠:体内新生多肽
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