PCR的退火温度选择.docx

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熔解温度是引物的一个重要参数这是当的引物和互补序列表现为双链分子时的温度对于设定退火温度是必需的在理想状态下退火温度足够低以保证引物同目的序列有效退火同时还要足够高以减少非特异性结合合理的退火温度从到退火温度一般设定比引物的低设定有几种公式有的是来源于高盐溶液中的杂交适用于小于碱基的引物有的是根据含量估算确定引物最可信的方法是近邻分析法这种方法从序列一级结构和相邻碱基的特性预测引物的杂交稳定性大部分计算机程序使用近邻分析法根据所使用的公式及引物序列的不同会差异很大因为大部分公式提供一个估算的值所

熔解温度( Tm)是引物的一个重要参数。这是当 %的引物和互补序列表现为双链 A分 子时的温度.Tm对于设定PCR退火温度是必需的。在理想状态下,退火温度足够低,以保证 引物同目的序列有效退火,同时还要足够高,以减少非特异性结合。合理的退火温度从 ℃ 到7 ℃。退火温度一般设定比引物的 Tm低 ℃。 设定 Tm有几种公式。有的是来源 于高盐溶液中的杂交,适用于小于 18碱基的引物。有的 是根据 GC含量估算 Tm。确定引物 m最可信的方法是近邻分析法。这种方法从序列一级结构 和相邻碱基的特性预测引物的杂交稳定性。大部分计算 机程序使用近邻分析法。 根据所使用的公式及引物序列的不同,Tm会差异很

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