研究不同立场对B-DNA到A-DNA构型转化过程产生的结果-生物化学论文-生物学论文.docxVIP

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2021-01-01 发布于江苏
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研究不同立场对B-DNA到A-DNA构型转化过程产生的结果-生物化学论文-生物学论文.docx

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研究不同立场对B-DNA到A-DNA构型转化过程产生的结果-生物化学论文-生物学论文 ——文章均为WORD文档，下载后可直接编辑使用亦可打印——　　摘要：采用分子动力学模拟方法比较了最新版CHARMM和AMBER （包括bsc1和OL15）力场对水溶液中B-DNA到A-DNA转化过程的影响，利用扩展自适应偏置力（eABF）方法计算了转化过程的自由能变化。研究结果表明，在不同力场下，水环境中的DNA最稳定结构存在差异， AMBER力场比CHARMM力场更符合实验结果。AMBER力场下DNA最稳定结构的小沟较窄，稳定于B构型；而CHARMM力场下DNA最稳定结构的小沟较宽，介于B