第三章 生物信息传递(上)-从dna到rna-说课稿.pptVIP

编码链（coding strand） 模板链（template strans）;;第一节 RNA转录的基本过程 第二节 转录机器的主要成分 第三节 启动子与转录的起始 第四节 原核生物与真核生物 mRNA 特征的比较 第五节 终止与抗终止 第六节 内含子的剪切、编辑及化学修释;第一节 RNA 的 转录;随机扩散;全酶-启动子形成闭合二重复合体； 闭合复合体转变为开放复合体； 整合进最初两个核苷酸，形成一个磷酸二酯键，形成三重复合体；;真核生物转录的起始;正常的延伸中，新的磷酸二酯键在特定的活性位点进行；;转录的终止;第二节 转录机器的主要成分;催化中心; 核心酶可以DNA为模板合成RNA，但不能在正确的位点起始。起始必须有σ 因子；σ 因子能够提高酶和启动子识别的特异性，同时也降低酶和非特异位点的亲和力。在某些细菌细胞内含有能识别不同启动子的σ 因子，以适应不同生长发育阶段的要求，调控不同基因转录的起始。;聚合酶前进时，将前端的DNA双链解旋，在后方则重新结合。 聚合酶所保护的DNA序列约为40 bp，而解旋的DNA区域大约17 bp，RNA的3‘端大约有20~30个核苷酸与DNA或聚合酶结合，而其中RNA-DNA杂交区仅约9 bp。; ; 真核生物RNA聚合酶一般由8~16个亚基所组成。其中RNA 聚合酶II的两个大亚基（RPB1和RPB2）与细菌核心酶的两个大（β和β‘）；（RPB3和RPB11）与α亚基同源；RPB6与ω亚基同源。 真核生物RNA聚合酶共性：聚合酶中有两个相对分子质量超过1X105的大亚基；三类聚合酶有共显小亚基的倾向。 ;RNA聚合酶I的转录产物是45S rRNA，经剪接修饰后生成除5S rRNA外的各种rRNA。 RNA聚合酶II在核内转录生成hnRNA，经剪接加工后生成成熟mRNA被运送到细胞质中作为蛋白质合成的模板。 核不均一RNA（heterogeneous nuclear RNA，hnRNA）：核内未被剪接的有内含子的mRNA前体，或是核内mRNA的初级转录产物。;RNA聚合酶III的转录产物是tRNA，5S rRNA，snRNA。 SnRNA（small nuclear RNA），即核内小RNA，主要存在于核内，是核内100~300个核苷酸序列的小型RNA，参与RNA的剪接。;2、转录复合物; 转录因子（transcription factor, TF）：真核生物转录起始过程中，除RNA聚合酶之外的其它辅助因子统称为转录因子。;小 结;第三节 ???动子与转录的起始;;转录单元 （transcription unit）;启动子区的基本结构;Date;TATA box：位于RNA聚合酶II转录起点上游约-35~ -25 bp处的共同序列TATAAA，绝大多数情况下全部是A-T碱基对，只有少数含有G-C。 CAAT box：在起点上游-78~-70 bp处还有另一段共有序列CCAAT，称为CAAT区。 GC box：在起点上游-110~-80 bp处有一段富含GC碱基对的序列（GCCACACCC或GGGCGGG），称为GC区。 增强子：能强化转录起始频率的DNA序列。;二、启动子区的识别;σ70的氨基酸与启动子-10区非模板链特异碱基的结合;Date;第四节 原核生物与真核生物 mRNA 特征的比较;2、许多原核生物 mRNA 以多顺反子的形式存在;β -半乳糖苷酶;mRNA;3、原核生物mRNA 5′端无帽子结构，3 ′ 端没有或只有较短的poly(A) 结构，在起始密码子AUG上游7~12个核苷酸处有6个核苷酸的保守序列，被称为SD序列。 SD序列在与核糖体的结合过程中起作用。;5′ 5′ Gppp + pppApNpNp... ↓ 5′ 5′ GpppApNpNp... + pp + p ;甲基化;帽子结构的作用: 1、提高mRNA的活性及稳定性； 2、作为蛋白质合成起始信号的一部分。;Pol I 和pol III 在特定的位点终止合成;Pol II无特定终止位点，3’-OH末端通过在特定位点切割后加上poly(A)来形成。 几乎所有真核基因的3’转录终止位点上游15~30 bp存在保守序列AAUAAA,该序列作为切割和添加poly(A)位点的信号。;特异组分（Cut and polyA Special factor, CPSF）识别AAUAAA序列； 产生正确的末端结构需要核酸内切酶（由CFI和CFII组成）切割RNA； 激发因子CstF，结合在切割位点下游一富含G-U的序列 poly(A)聚合酶（PAP）合成poly(A)尾部； 。;小 结;第五节