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RNA 提取心得/经验/体会/纪律(RNA 提取注意事项)!
纪律一:杜绝外源酶的污染。
注意一:操作环境干净无灰尘,严格戴好口罩,手套。
注意二:实验所涉及的离心管,Tip 头,移液器杆,电泳槽,实验台面等要 彻底处理。
注意三:实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保 RNase-Free。
纪律二:阻止内源酶的活性
注意四:选择合适的匀浆方法。
注意五:选择合适的裂解液。
注意六:控制好样品的起始量。
纪律三:明确自己的抽提目的
注意七:任何裂解液系统在接近样品最大起始量时,抽提成功率急剧下降。
注意八:RNA 抽提成功的唯一经济的标准是后续实验的一次成功,而不是得 率。
Rnase 污染的 10 大来源
1:手指头 – 手指头是外源酶的第一来源,所以必需戴手套并且频繁更换。另 外,口罩也必需戴,因为呼吸也是一个重要的酶来源。戴手套口罩的另外的好处 是保护实验人员。
2:枪头,离心管,移液器 – 单纯的灭菌是不能灭活 Rnase 的,所以枪头和离 心管要用 DEPC 处理,即使是标明为 DEPC 处理过的。移液器最好是专用的,用 前用 75% 的酒精棉球搽拭干净,尤其是杆子;另外,一定不要使用褪头器。
3:水/缓冲液 – 一定要确保无 Rnase 污染。
4:实验台面 – 最起码要用 75% 的酒精棉球搽拭干净。
5:内源 Rnase – 所有组织均含内源酶,故组织用液氮速冻是降低降解的最好 办法。液氮保存/碾磨方法的确不方便,但对有一些内源酶含量很高的组织,却 是唯一的办法。 ;6:RNA 样品 – RNA 抽提产物可能都会含痕量的 Rnase 污染。
7:质粒抽提 – 质粒抽提往往用到 Rnase 降解 RNA,残留的 Rnase 要用 Proteinase K 消化,PCI 抽提。
8:RNA 保存 – 即使低温保存,痕量的 Rnase 亦会导致 RNA 降解。长期保存 RNA 的最好办法是盐/醇悬液,因为醇在低温时抑制所有的酶活性。
9:阳离子 (Ca, Mg) – 在含这些离子时,80C 加热 5 分钟会导致 RNA 被剪切, 故如果 RNA 需要被加热,保存液需要含螯合剂 (1mM Sodium Citrate, pH 6.4)。
10:后续实验所用的酶 – 酶均有可能被 Rnase 污染。 RNase 和 DEPC 处理
1:高压灭菌是可以灭活部分 Rnase A 的。实验证明:37 C 与 RNA 反应,没有 灭菌的 PBS,活性点为 100 pg/ml;灭菌后,活性点为 100 ng/ml。当然,灭菌 后 Rnase 仍然不能认为没有残留。
2:DEPC 在水中半衰期为 30 分钟。0.1% 的 DEPC 灭菌 15 分钟可以认为彻底 破坏了 DEPC。破坏后可以闻到一点气味。
3:在 1M Tris, 1M HEPES, 1M MOPS 中分别加入 1ug/ml Rnase A 和 0.1% 及 1% DEPC 实验。结果提示,0.1% DEPC 只对 MOPS 有效,而 1% DEPC 对三种试剂都 有效。
4:0.01% DEPC,0.1% DEPC,1% DEPC 有效去除 Rnase A 的浓度分别为:100 ng/ml,500ng/ml,1 ug/ml。但要注意,DEPC 灭活后的副产品,对有些后续实 验是有影响的。我也来谈谈 RNA 的提取,我觉得 14 楼说的方法很严格,但是有 时候我们其实不必在过多的细节上太紧张。而在有些步骤一定要小心了。以下的 内容,是讲给那些既想偷懒,有希望实验结果有保证的人听的,如果你是习惯于 每一步都很严格的人的话,建议还是按照 14 楼的方法做,因为那样才是正途啊。
好了,下面是给想偷懒,但又不想搞砸实验的战友看的。用最少的时间,Money, 力气,来做出最好的结果,是我们的终极目标(PS:我相信一句话,懒人推动科 技进步!个人愚见,大家不要拍我啊)。我是做植物的,所以以植物 RNA 提取为 例子:
一、关于器皿的处理:
枪头 ep 管最好是用 DEPC 处理一下,当然如果老板钱多的话,尽管用进口的 RNase-Free 的吧。这里,如果你想要偷点懒,也是有办法的,就是少处理一些 ep 管,因为后面我们会讲到,不是所有的 ep 管都一定要处理的。
研钵,这个东西按要求是要高温干燥处理的,但是在实际实验中,如果你不 处理的话,也不会有太大的影响。因为在一般我们要处理的材料上都会带有很多;3;4;5;6;7
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