蛋白质组学技术及其应用.pdfVIP

蛋白质组学技术及其应用 一、蛋白质组和蛋白质组学基本概念 蛋白质组(proteome) 1. 蛋白质组是指一个细胞、一个组织或一种生物的基因 组所表达的全部蛋白质总和。蛋白质组“proteome”的 概念是由澳大利亚学者Wilkins和Williams等人于1994 年提出。 2. 作为基因表达产物的蛋白质，其种类和数量在不同的 时间及环境下是不同的。蛋白质组是一个动态变化集 合，与时空、生理和病理状态密切相关。 蛋白质组学(proteomics) 1. 蛋白质组学是以生物体的全蛋白质组为研究对象，分析蛋白 质组成、翻译后修饰、相互作用网络及其动态变化的科学。 2. 蛋白质组学研究不仅是生命科学研究进入后基因组时代的里 程碑，也是后基因组时代生命科学研究的核心内容之一，蛋 白质组学技术也成为生命科学研究不可或缺的技术。  1996 年，澳大利亚建立了世界上第一个蛋白质研究中心 （Australia Proteome Analysis Facility, APAF)  2001 年4 月，在美国成立了国际人类蛋白质组组织 （Human Proteome Organization, HUPO)  中国于2003 年成立中国人蛋白质组组织 （Human Proteome Organization, CNHUPO)  2002-2003年，陆续启动人类血浆、肝脏、脑的蛋白质组研究国际 合作计划。 基因编码蛋白质的复杂性 据估计：  酵母中1个基因平均可编码1.3种蛋白  果蝇中1个基因平均可编码3种蛋白  人的1个基因大约可编码10种蛋白  人类基因组的3-4万个基因可能生产出几十万个蛋白 原因：  一个基因可经过基因内重组或在转录中经过不同的 剪接翻译成不同蛋白质。  蛋白质翻译后修饰。 基因组vs蛋白质组 1 同一性 多样性 基因组作为遗传信息的载体，其最主要的 特征是同一性。基因组始终不变。 2 有限 无限 基因组不论大小，其核苷酸数量是明确的。 3 静态 动态 一个个体的基因组自个体诞生到死亡，始 生命活动功能执行者蛋白质组在 终保持不变。 个体的生命活动中总是变动不停。 4 时间 时间与空间 DNA位于细胞核内，比较稳定，其序列不 表达与时间相关，功能与其空间 受时空影响。mRNA的表达与时间有关。 定位密切相关。 5 孤立行为？ 相互作用 基因表达的各种mRNA彼此孤立，互不干 蛋白质彼此间有着广泛的相互作 扰。 用。 6 单一手段 多种技术 测序技术 分离技术，生物质谱，其它 二、蛋白质组学分类 • 表达蛋白质组学（Expressional Proteomics ） – Electrophoresis (1DE, 2DE), HPLC, Protein Chips….. – Mass Spectrometry • 功能蛋白质组学（Functional Proteomics ） – Yeast 2-hybrid system, Pull-down, TAP, Co-IP – Mass Spectrometry • 结构蛋白质组学（Structural P