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河口及海洋环境中氨氧化微生物的研究成果综述
Abstract:Ammonia-oxidizing microorganisms ( AOMs) regulate the first step of nitrification in the geochemical cycle of nitrogen, which can oxidize NH3 in the habitat to nitrite NO-2.With the in-depth study of the function and role of microorganisms in geochemical cycling, the study of ammonia-oxidizing microorganisms in the major estuaries and oceans has also attracted much attention.AOMs has different niche differentiation in different environments.The abundance of ammonia-oxidizing bacteria ( AOB) and ammonia-oxidizing archaea ( AOA) is significantly different in estuarine and marine environments, and the community structures of AOB and AOA are also significantly different.In estuaries and oceans, environmental factors such as salinity, temperature, nitrogen content, carbon content and dissolved oxygen are significantly different.Analyzing the effects of different environmental factors on AOMs and understanding the spatiotemporal dynamics, community structure change and niche differentiation characteristics of AOMs are the theoretical basis for studying microbial nitrogen geochemical cycle. Keyword:oceans; estuaries; sediments; Ammonia-oxidizing microorganisms AOMs; niche; 自然界中氮循环的四个主要过程, 即固氮作用、硝化作用、反硝化作用和氨化作用均由各生态系统中的环境微生物催化转化, 其中硝化作用需在AOMs和亚硝酸氧化细菌的共同参与下才能完成由氨或铵离子到硝酸盐的转变过程, 从而达到增加环境中微生物可利用氮素营养的效果[2,3]。氨氧化作用 (NH3rarr;HNO2) 作为硝化作用第一步, 限制着氮循环的反应速度[4], 涉及到该过程的氨氧化微生物类群主要为AOB和AOA两类, 它们在环境中通过氨单加氧酶 (AMO) 可以氧化环境中的NH3 (如图1所示) 。而AOB与AOA两者在不同生态环境中的生理分化、地域分化等也随之不同[5]。因地理位置的空间差异到环境改变的时间差异, 以及各种环境因子带来的影响导致AOMs的丰度、群落结构和功能显着不同, 加上微生物种间竞争和底物浓度高低的影响, 导致在每种环境中AOMs具有独特的生态位分化。 近年来, 分子生物学技术从基因水平上推进了AMOs的研究, 通过16S rRNA基因与功能基因的研究, 发现氨氧化细菌和氨氧化古菌普遍存在于土壤[6]、淡水[7]、海洋[8]、河口[9]区域, 甚至存在于高温热泉[10]、南极土壤[11]等极端环境中。因为AMOs对环境中氨的转化作用, 其研究备受全球关注。AOMs催化着氨 (NH3) 的有氧氧化为亚硝酸盐 (NO2-) , 该步骤的代谢标志物是氨单加氧酶, 相应的编码基因amo基因存在于细菌和古菌内, 现在已经成为环境微生物学中应用最广泛的分子标志物之一[12]。 河口和海洋区域作为地球化学循环中氮循环的重要发生区域, 具有复杂多样的生态环境, 氨氧化作用在这些区域调节着氮循环。据报道, 氨氧化作用导致海洋中大部分
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