生物化学第十二章 蛋白质的生物合成.pptVIP

第十二章 蛋白质的生物合成 第一节、遗传密码的主要性质 遗传密码（genetic code）：核酸中的核苷酸残基序列与蛋白质中的氨基酸残基序列之间的对应关系。连续的3个核苷酸残基序列为一个密码子，特指一个氨基酸。标准的遗传密码是由64个密码子组成的，几乎为所有生物通用。 起始密码子： 密码子AUG（编码Met）又称起始密码子。 终止密码子 3个不编码任何氨基酸而起肽链合成的终止作用的密码子，称为终止密码子，它们是UAG、UAA、UGA。（无义密码子: 指三个终止密码子） 主要性质： 1.密码的基本单位； 2.密码的简并性; 3.密码的变偶性; 4.密码的通用性和变异性; 5.密码的防错系统。 密码的基本单位 按5’→3’方向编码（阅读） 不重叠 密码子是不重叠的，每个三联体中的三个核苷酸只编码一个氨基酸，核苷酸不重叠使用 噬菌体?x174中某些基因之间有重叠现象 无标点 编码一个肽链的所有密码子是一个接着一个地线性排列，密码子之间既不重叠也不间隔，从起始密码子到终止密码子构成一个完整的读码框架（不包括终止密码子），又称开放阅读框架（ORF）。 如果在阅读框中插入或删除一个碱基就会使其后的读码发生移位性错误（称为移码）。 两个基因之间或两个ORF之间可能会互相部分重叠（共用部分序列）。 2.密码的简并性（degeneracy） 几种密码子编码一种氨基酸的现象称为密码子的简并性。 这些密码子为同义密码子。 例GGN（GGA、GGU、GGG、GGC）都编码Gly，那么这4种密码子就称为Gly的简并密码。 大部分氨基酸有多个密码子，以2～4个居多，可有6个。只有Met和Trp没有简并密码。 简并性的生物学意义： A、可以降低由于遗传密码突变造成的灾难性后果 试想，如果每种氨基酸只有一个密码子，那么剩下的44个密码子都是终止密码子，如果哪个氨基酸的密码子发生了单碱基的点突变，极有可能造成肽链合成的过早终止。如GUU编码Ala，由于简并性的存在，不论第三位的U变成什么，都仍然编码Ala B、可以使DNA上的碱基组成有较大的变化余地，而仍然保持多肽上氨基酸序列不变（意思基本同上）。 3.密码的摆动性（变偶性） 密码子中第三位碱基与反密码子第一位碱基的配对有时不一定完全遵循A-U、G-C的原则，也就是说密码子的碱基配对只有第一、二位是严谨的，第三位可有一定变动，Crick把这种情况称为摇摆性，有人也称摆动配对或不稳定配对。 密码子的第三位和反密码子的第一位是摇摆位点。 例：反密码子第一位的G可以与密码子第三位的C、U配对，U可以与A、G配对，另外反密码子中还经常出现罕见的I，可以和密码子的U、C、A配对，这使得该类反密码子的阅读能力更强。 摆动假设(Wobble hypothesis) 摆动假设解释了密码子简并现象，即简并密码子代表了同一种氨基酸是由于允许密码子第三位碱基非标准化配对。 按照Wobble假说密码子与反密码子配对 4.密码的通用性和变异性 通用性：生物界有一套共同的遗传密码（交叉试验证实） 密码子在不同物种间几乎是完全通用的； 绝大多数密码子对各种生物都适用。 变异： 目前只发现线粒体和叶绿体等有例外情况。 密码子的使用频率不同； 不同生物往往偏爱某一种密码子。 线粒体中存在不同的密码子的比较 密码表 5.密码的防错系统 密码子第2位碱基决定AA的极性 U：非极性、疏水和支链的AA C：非极性或不带电荷的极性侧链 A或G：亲水性的AA，在球蛋白外周。。 第一位是A/C A/G 第3位可以为任意碱基： 具有可解离极性侧链的碱性AA （GAN：酸性亲水侧链AA） 中心法则 生物的遗传信息从 DNA传递给 mRNA的过程称为转录。根据 mRNA链上的遗传信息合成蛋 白质的过程，被称为翻译和 表达。1958年Crick将生物 遗传信息的这种传递方式称为中心法则。 第二节 蛋白质合成的 分子基础 mRNA----模板rRNA----构成核糖体作为蛋白质合成场所tRNA----搬运工具氨基酸----原料酶----氨基酰-tRNA合成酶，转肽酶，转位酶等蛋白质因子(起始因子IF，延伸因子EF，释放因子RF等)无机离子----Mg++ 一、mRNA 蛋白质合成的模板 mRNA是遗传信息的携带者 原核细胞mRNA的结构特点 真核细胞mRNA的结构特点 大量实验证明mRNA上相邻三个碱基编码一种AA，因而被称为碱基三联体或密码子。 四种核苷酸，能有43 =64组密码子 1966年已经完全查清了20种基本氨基