生物信息学技术在病原生物学的应用.docVIP

时间： TIME \@ yyyy年M月d日 2021年3月13日 学海无涯 页码：第 PAGE 1页共 NUMPAGES 1页 PAGE PAGE 1 生物信息学技术在病原生物学的应用 摘要：从生物信息学技术以及病原生物学的角度出发，对生物信息学技术在病原生物学中的详细应用进行介绍，从教学层面提出生物信息学技术在病原生物学中的应用对策，以期为有关部门、人员提供可靠参考。 关键词：生物信息学技术；病原生物学；疫苗研发；致病机制 生物信息学技术的本质主要是在与生物学、数学以及计算机科学相互配合下，对收集到的数据加以分析与研究。在科技水平不断提升的大背景下，病原生物学领域的信息数据越来越多，生物信息学技术与之交叉融合，能在病原生物的鉴定、新药研发以及研究致病原因等层面取得重大突破。 1生物信息学技术与病原生物学概述 1.1生物信息学技术概述 20世纪80年代，生物信息学技术逐渐被研发利用[1]。该学科属于一类交叉式学科，主要涵盖了计算机、数学以及生物学科等。主要是全面收集、分析以及整理生物信息，随后借助计算机学科以及数学学科对上述生物信息本质意义进行深入了解。如该项学科主要的研究方向包含了脂质组、基因组、蛋白质组以及基因转录组4项，但在对蛋白质组进行研究时，能利用生物信息学技术深入分析蛋白质组，也能把该项技术应用于深入研究未知的蛋白质结构。另外，生物信息学技术还极度依赖生物信息大数据库。 1.2病原生物学概述 病原生物学主要的研究对象包含医学节肢动物、原虫在内的寄生虫，以及与疾病关联密切的病毒、细菌等微生物的致病原理及生物学规律。在基础医学中，病原生物学科是主要构成部分之一。该项学科主要研究方向为致病性原虫分子工程抗体、有关细菌致病基因调控与功能的相关研究。世界范围内经常出现各种流行疾病，如埃博拉病毒以及非典型肺炎等都曾大面积传播蔓延，使众多民众失去生命，这两种疾病均是由细菌类病毒等致病微生物引发的，因此各个国家都鼓励加强在该领域中的科学研究，同时在高校中设立相应的“病原生物学”学科。 2生物信息学技术在病原生物学中的应用 2.1鉴定寄生虫 当运用病原生物学鉴定寄生虫时，有关部门能借助生物信息学技术中的蛋白质组学展开深入分析，就可以有效鉴定寄生虫各阶段蛋白质的主要组成成分。对于寄生虫，其各生活阶段呈现出的蛋白质图谱，属于鉴定寄生虫关键组成成分的一项重点内容。有关生物学家在深入分析研究“杜氏利什曼”原虫蛋白质组时，鉴定出许多新基因[2]。经深入分析“杜氏利什曼”原虫不同成长阶段蛋白质谱，可以研究出此类原虫药物靶点，进而研发出对应抗性药物，最终推动我国生物药学整体得到全面发展。 2.2鉴定真菌 鉴定真菌可以借助生物信息学技术中的基因芯片技术得以实现。基因芯片技术是由精准、高效的仪器与技术，对基因信息加以分析。因此，将基因芯片技术运用到检定病原生物领域中，运用前景十分良好。通常基因芯片技术运用的分析软件为Arraypro，该软件除了可以深入分析基因图像，还可以及时处理各类基因数据。部分生物学家在对人体皮肤的病原真菌进行深入研究时，能借助生物信息学技术中PCR的“DNA微列阵”方式对真菌进行有效鉴定，随后再借助上述分析软件以及“Prism”软件全面分析鉴定基因相应的数据，此方法真菌鉴定结果精准度超过90%。 2.3鉴定病毒 有关部门借助生物信息学技术，研发出一种较新颖的鉴定病毒技术，即“基因组条形码”技术。此项技术重点是借助病毒DNA中某段待测片段，随后经由此片段精准、快速地对物种展开鉴定，属于新型的鉴定技术。此项技术可以有效鉴定与分类各种病毒，与以往传统“基因序列”的鉴定技术相比，该新技术可以把其难以表现、鉴定出来的数据信息等有效表现出来。另外一项有效的鉴定病毒新技术是“高通量测序”技术，此项技术可以在一次鉴定过程中，全面序列测定上百万条的DNA分子。在实际对病毒高通量测序生成的各项DNA信息数据展开鉴定时，采用的软件通常为GLCGenomicWorkbench。 2.4鉴定细菌 目前，在鉴定细菌时最常见的鉴定方式包含分子遗传学鉴定法以及表型鉴定法两大类。然而在生物信息学技术高速发展的新时期，经由生物信息学技术便可以研发出全新的鉴定技术，而此项鉴定技术具备极高的分辨率，即“多位点序列分析”技术。该项技术主要是经由生物信息学技术测序鉴定DNA，此技术比传统的细菌鉴定方法更快捷、方便。同时，另一种新鉴定方法为“电离飞行时间/基质辅助激光质谱”法，此方法主要借助生物信息学技术鉴定新型微生物，重点是借助细菌蛋白质的指纹图谱特点对细菌加以鉴定。在实际鉴定细菌过程中，重点是经由生物信息学技术SPE-CLUST聚类分析的软件以及SpectraBank大数据库，对细菌相应数据展开分析，进而有效鉴定细菌。 2.5在新药物研发以及疾病